Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   
3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaattccttaaaaactttattatgtagtaagacttaaagatactagccttttgatcatgatcaagagtcttgaatttatacaattaatatcaaatttatcttaattttggcaataattaatttagCATACCAT

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G33950.1
intron # 2
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgaatttatacaattaatatcaaatttatcttaattttggcaataattaatttagCATACCAT
                                            aattaat  putative branch site (score: 3)
 aattaatatcaaattt  TA-rich tract