Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGCACCAGCTCGTTGAAAATGCAGATGAATGCATGGTTTTGGATAACGAAGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcatctcaccaattcttttgcctgtgatgctttttcatctctttgattcatttactgacattgtgcgtttgttcttgtttctgaaacag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G29840.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|37996610|gb|CF808199.1|CF808199
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193710159|gb|FK642857.1|FK642857
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208172258|gb|GD968889.1|GD968889
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCTGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCA
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCA
EST: gi|193730560|gb|FK665324.1|FK665324
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193725883|gb|FK660191.1|FK660191
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193411825|gb|FK379898.1|FK379898
EST:     AGCTCTCTACGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193421220|gb|FK391409.1|FK391409
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193312524|gb|FK276532.1|FK276532
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|14990926|gb|BI316599.1|BI316599
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193365894|gb|FK329419.1|FK329419
EST:     GCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGT
genomic: GCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCC-AAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGT
EST: gi|207708955|gb|GD690483.1|GD690483
EST:     AAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193587912|gb|FK543059.1|FK543059
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTG
EST: gi|193430877|gb|FK393697.1|FK393697
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCA-CCTTAAGCTCACCA-CCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193618546|gb|FK572040.1|FK572040
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193323108|gb|FK292102.1|FK292102
EST:     CTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: CTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208181748|gb|GD978543.1|GD978543
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193474928|gb|FK442479.1|FK442479
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208293148|gb|GE096398.1|GE096398
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193625653|gb|FK574771.1|FK574771
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCCTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208241085|gb|GE039593.1|GE039593
EST:     CACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: CACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208238279|gb|GE039927.1|GE039927
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|207749581|gb|GD720971.1|GD720971
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGGCATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|207714143|gb|GD694922.1|GD694922
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193406528|gb|FK371833.1|FK371833
EST:     CTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: CTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193452924|gb|FK420744.1|FK420744
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACC
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACC
EST: gi|16346405|gb|BI972000.1|BI972000
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193546503|gb|FK500944.1|FK500944
EST:     TATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: TATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193551699|gb|FK506874.1|FK506874
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208239900|gb|GE038202.1|GE038202
EST:     CTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: CTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193725523|gb|FK660615.1|FK660615
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCA
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCA
EST: gi|193328418|gb|FK295993.1|FK295993
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193635333|gb|FK582518.1|FK582518
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTG
EST: gi|207831114|gb|GD801994.1|GD801994
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193330285|gb|FK294877.1|FK294877
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|7691305|gb|AW759498.1|AW759498
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208184411|gb|GD983781.1|GD983781
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208327244|gb|GE118070.1|GE118070
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATG
EST: gi|207775971|gb|GD748200.1|GD748200
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|15204055|gb|BI426823.1|BI426823
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193625949|gb|FK576705.1|FK576705
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193315210|gb|FK282606.1|FK282606
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193347381|gb|FK309375.1|FK309375
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193337399|gb|FK303773.1|FK303773
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193491524|gb|FK453878.1|FK453878
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|16347903|gb|BI973498.1|BI973498
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193376560|gb|FK342281.1|FK342281
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193668450|gb|FK609356.1|FK609356
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|207732074|gb|GD706217.1|GD706217
EST:     CTCTCTATG-CAATAATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAG
genomic: CTCTCTATGACA-TA-TGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAG
EST: gi|208087568|gb|GD887658.1|GD887658
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGA
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGA
EST: gi|193410253|gb|FK377164.1|FK377164
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193452621|gb|FK417585.1|FK417585
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208051723|gb|GD852560.1|GD852560
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGG
EST: gi|193692537|gb|FK632444.1|FK632444
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGA
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGA
EST: gi|208297616|gb|GE094483.1|GE094483
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATAGT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACAT-GT
EST: gi|193393704|gb|FK360690.1|FK360690
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATC-TGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGT
EST: gi|193483808|gb|FK449327.1|FK449327
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208275446|gb|GE079396.1|GE079396
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAG
EST: gi|207831769|gb|GD804273.1|GD804273
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATTTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|7691747|gb|AW759868.1|AW759868
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193468452|gb|FK429982.1|FK429982
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193539600|gb|FK495140.1|FK495140
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193660005|gb|FK606023.1|FK606023
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193587584|gb|FK542619.1|FK542619
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193714404|gb|FK654975.1|FK654975
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193707323|gb|FK644137.1|FK644137
EST:     TGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: TGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|7692931|gb|AW761030.1|AW761030
EST:     GCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: GCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193401318|gb|FK369211.1|FK369211
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193418645|gb|FK383051.1|FK383051
EST:     AGCTCTCTATGACGTATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|4313952|gb|AI461071.1|AI461071
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|298182692|gb|HO031427.1|HO031427
EST:     AGCTCTCTATGACACATGCTACCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|207791735|gb|GD764958.1|GD764958
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTTAATTTCAAGCCACCATG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCT-AATTTCA-GCCACCATG
EST: gi|207784168|gb|GD755021.1|GD755021
EST:     CCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: CCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|207848451|gb|GD818356.1|GD818356
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATG
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATG
EST: gi|193380085|gb|FK348267.1|FK348267
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193713083|gb|FK651506.1|FK651506
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTACAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTT-CAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGT
EST: gi|193726839|gb|FK659787.1|FK659787
EST:     TGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: TGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|6482491|gb|AW201748.1|AW201748
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193303221|gb|FK267977.1|FK267977
EST:     ACCA-CCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: ACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208239950|gb|GE042718.1|GE042718
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193409708|gb|FK375014.1|FK375014
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193343007|gb|FK307743.1|FK307743
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCAC
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCAC
EST: gi|208303577|gb|GE101322.1|GE101322
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|9565169|gb|BE474678.1|BE474678
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATT
EST: gi|208319485|gb|GE117636.1|GE117636
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATACTAATTTCACGCCA
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCAT-CTAATTTCA-GCCA
EST: gi|193400227|gb|FK367882.1|FK367882
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193650046|gb|FK598037.1|FK598037
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193411157|gb|FK377676.1|FK377676
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACC-TTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTTAATTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCT-AATTT
EST: gi|208122872|gb|GD925440.1|GD925440
EST:     ACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: ACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|208267223|gb|GE065600.1|GE065600
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|10848079|gb|BF070632.1|BF070632
EST:     AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCT                         TTTGAGATCTGAACCATCTAATTTCAACCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: AGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
EST: gi|193369065|gb|FK334787.1|FK334787
EST:     ACCACCCCAAGCT                         TTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT
genomic: ACCACCCCAAGCTgtgagttcat ... tctgaaacagTTGGAGATCTGAACCATCTAATTTCAGCCACCATGAGTGGTGTGACATGTT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTGCACCAGCTCGTTGAAAATGCAGATGAATGCATGGTTTTGGATAACGAAGCTCTCTATGACATATGCTTCCGCACCCTTAAGCTCACCACCCCAAGCTgtgagttcatctcaccaattcttttgcctgtgatgctttttcatctctttgattcatttactgacattgtgcgtttgttcttgtttctgaaacag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT