1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GCTTTGCTGCATGCCCTTGGTGATAGGAAGGGTATTAACCGGTTTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttcatactgtttgtagaaataatcatcaattattagttaatgttaacatgtaggtggcaggaaagtgagatttgtccttgcttataaacatggt...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G28420.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
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genomic: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATT-TGGACATACCCACTCA
EST: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTG GATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAGEST: gi|151393539|gb|EV263414.1|EV263414
genomic: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAG
EST: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTG GATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAGEST: gi|120528949|gb|EH257083.1|EH257083
genomic: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAGTTATAATTTGGACATACCCACTCAG
EST: TAGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTATCACTG GATTTGTCTGGCCGAACACATCTAAG
genomic: TTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttca ... actttttcagGATTTGTCTGGCCGACCACATCTAAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCTTTGCTGCATGCCCTTGGTGATAGGAAGGGTATTAACCGGTTTGGTAACTTCTCTGCTCCTCTTGATGAAGCATTGATACATGTTTCACTGgtaattttcatactgtttgtagaaataatcatcaattattagttaatgttaacatgtaggtggcaggaaagtgagatttgtccttgcttataaacatggt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTCCTC
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