1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...attgaaaaaacatgcttctcatgttgttatattgataagataggattatggtgtgaactaactgtttttttatgtttctggtttatttgatttgcaatagGTGCTCTTTACTGTATATGCAAAGATGGTGTGAGTGATCAAACCCTTCAGAAAGCAATAGATTATGCTTGTGGAACTGGAGCTGACTGTACCCCTATTCT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G03100.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
ttatggtgtgaactaactgtttttttatgtttctggtttatttgatttgcaatagGTGCTCTTTACTGTATATGCAAAGATGGTGTGAGTGATCAAACCCTTCAGAAAGCAATAGATTATGCTTGTGGAACTGGAGCTGACTGTACCCCTATTCT
taactgtttttttat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| attgaaaaaacatgcttctcatgttgttatattgataagataggattatggtgtgaactaactgtttttttatgtttctggtttatttgatttgcaatagGTGCTCTTTACTGTATATGCAAAGATGGTGTGAGTGATCAAACCCTTCAGAAAGCAATAGATTATGCTTGTGGAACTGGAGCTGACTGTACCCCTATTCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - -acatgct
- - - - - - - - - tcatgtt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tggtgtg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctaactg