Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TTCAACGGAGAGTGACTTGGATGAGAATGACCAAGGCAAAGATTGTGTCATTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcagcttccctttttgaatgaatttttctttgattagttgatagaacgatgctgatgtgatggtagtcatcaatatcataatcaatcttttatc...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G36510.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|19053880|gb|BM732547.1|BM732547
EST:     TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|193593352|gb|FK547046.1|FK547046
EST:     GCCGGGATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: GCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|209720274|gb|BW674616.1|BW674616
EST:     TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|6072168|gb|AW101555.1|AW101555
EST:     TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|16342102|gb|BI967697.1|BI967697
EST:     GAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: GAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|208291346|gb|GE094568.1|GE094568
EST:     GCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: GCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|31306893|gb|CD392096.1|CD392096
EST:     TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCCAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|22523525|gb|BU082336.1|BU082336
EST:     TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: TTTGCTGGTCAGAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
EST: gi|6072057|gb|AW101376.1|AW101376
EST:     GAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATG                         TGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC
genomic: GAGCCTCGAGATACAATTGTCCATCCCTGCCGGCATATGgtatttgcag ... gtatttgcagTGTATGTGTAGTGGATGTGCAAAGGTTTTGAGGTTCCAGACGGATAGATGC