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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAGCTTGATGCTCAGCCAGAGTTGTTCATTCACATTATTCCTGACAAGACCAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaaatattttgttagtctttgtgagattatcgccaactgtgcttgttagttagtctgttttctctaatgcttgtgcgtttgatgttccag

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA14G01530.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|213618380|gb|DB969378.1|DB969378
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|213587990|gb|DB957449.1|DB957449
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|213597843|gb|DB962196.1|DB962196
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|209700012|gb|BW652924.1|BW652924
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|213613889|gb|DB960910.1|DB960910
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|6724508|gb|AW308907.1|AW308907
EST:     GCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: GCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|18041089|gb|BM309383.1|BM309383
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|6501961|gb|AW203334.1|AW203334
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|11274820|gb|BF325146.1|BF325146
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAAGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|209723071|gb|BW662447.1|BW662447
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|6667546|gb|AW278997.1|AW278997
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|213598667|gb|DB964261.1|DB964261
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
EST: gi|17024084|gb|BM095118.1|BM095118
EST:     CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTG                         ATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA
genomic: CAACAACACATTGTCTATCATTGACAGTGGTATTGGCATGACTAAGGCTGgtaagattaa ... gatgttccagATTTGGTGAATAACCTCGGTACTATTGCAAGGTCTGGGACCAAGGAATTCA