1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
TAAGGCTGATGTTTTCCATTTGCTGTCTGGCATGTGGAAAACACCTGCTGAGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttatgctgatccttttcattctagtttcatggtttagaaaacgggttttgtagattagtaatggacagttttgtttaaattttttaaaaagaag...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G26280.1 |
intron # | 10 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|192329072|gb|FK021425.1|FK021425
genomic: GAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|9566058|gb|BE475629.1|BE475629
genomic: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|19346060|gb|BM890940.1|BM890940
genomic: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|13252262|gb|BG363165.1|BG363165
genomic: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|9902977|gb|BE611945.1|BE611945
genomic: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: GGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|254339872|gb|GR857997.1|GR857997
genomic: GGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: GTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATCEST: gi|10843100|gb|BF067155.1|BF067155
genomic: GTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
EST: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAG CTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
genomic: AGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttat ... tgcattgcagCTGCTGGTAAGTCAATTGGAGCCTCTCACAGAGCAGCAGCTGATGGGTATC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TAAGGCTGATGTTTTCCATTTGCTGTCTGGCATGTGGAAAACACCTGCTGAGAGGTGTTTTTTGTGGCTTGGTGGTTTTCGGTCATCTGAACTTCTCAAGgtgaggttatgctgatccttttcattctagtttcatggtttagaaaacgggttttgtagattagtaatggacagttttgtttaaattttttaaaaagaag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaaaagaa