1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
TCGAGAGTGGGATTATGCCAGGTTTAGGCACATTGCGGATAAGTGTGGAGCTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaatattttcgtcgtcctaaacctttatatgttgttcatggttgttgcttgtgaaaatttgtgtttgttgatgtgtcactacattaattttatgc...
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G20050.1 |
intron # | 1 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACEST: gi|213593771|gb|DB957891.1|DB957891
genomic: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
EST: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACEST: gi|7588515|gb|AW704239.1|AW704239
genomic: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
EST: GGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCACEST: gi|22539881|gb|BU089724.1|BU089724
genomic: GGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
EST: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAG GAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
genomic: CTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaata ... gtctttgcagGAATGTGTGAATCCTTTTGATTATTGTGACATTGTTACTTCAACAACTCAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TCGAGAGTGGGATTATGCCAGGTTTAGGCACATTGCGGATAAGTGTGGAGCTGTGTTGTTGTGTGACATGGCGCAGATTAGTGGCATAATTGCAGCCAAGgtgtgaaatattttcgtcgtcctaaacctttatatgttgttcatggttgttgcttgtgaaaatttgtgtttgttgatgtgtcactacattaattttatgc
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