1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtataacatacctattccctttcttaaacttaaatttccctctgaatttttcttgattatatatagttcactttcatgaaatgatttatattctaattattgccagACATGAATGGTAACACTGCACTATGGGATGCTATAGCATCAAAACATTACTCAATATTCCGGATCCTCTTCCAGCTTTCTGCTCTCTCTGATCCAAACAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G20030.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGCATGCATGCAACATGCATATAAAAG ACATGAATGGTAANNCTGCACTATGGGATGCTATAGCATCAAAACATTACTEST: gi|14011854|gb|BG726776.1|BG726776
genomic: AGCATGCATGCAACATGCATATAAAAGgtataacata ... ttattgccagACATGAATGGTAACACTGCACTATGGGATGCTATAGCATCAAAACATTACT
EST: AGGGTGTGTTAAAGTCTTACTCAAGCATGCATGCAACATGCATATAAAAG ACATGAATGGTAACACTGCACTATGGGATGCTATAGCATCAAAACATTACT
genomic: AGGGTGTGTTAAAGTCTTACTCAAGCATGCATGCAACATGCATATAAAAGgtataacata ... ttattgccagACATGAATGGTAACACTGCACTATGGGATGCTATAGCATCAAAACATTACT
cttgattatatatagttcactttcatgaaatgatttatattctaattattgccagACATGAATGGTAACACTGCACTATGGGATGCTATAGCATCAAAACATTACTCAATATTCCGGATCCTCTTCCAGCTTTCTGCTCTCTCTGATCCAAACAT
ttctaat putative branch site (score: 2)
tttcatgaaatgattt TA-rich tract