Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tattagttgttatttttcgttagaatattagtgggagatattcgaacccgcccaccacatttctcttcagaatttgatttattatgtttctgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA08G19210.1
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA08G19210.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
lower sequence: AT1G15820.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 1
tattagttg-ttatttttcgttagaatattagtgggagatattcgaacccgcccaccacatttctcttcagaatttgatttattatgtttctgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA
  | | ||| || |  || |||||   | |     ||||   |  ||  | |  |     | |  |      |||   |  | | ||| |   | | ||||||||||||| || |  || || |||||| | ||  | ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| 
-ctcatttggttctaatttgttagctgaatctcaagagagcatgaaaagcccgaattgtttgttacccagttattgagtcaaatgtgtgtgatattcgcagGCTACCAGGAGATTTCGGGTTCGACCCATTGGGTTTGGGGAAAGACCCGGCTTTTCTGAAATGGTACAGAGAGGCTGAGCTGATCCATGGCCGATGGGCG

upper sequence: GLYMA08G19210.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
lower sequence: Vv12s0055g01110.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
----------------------tattagttgttattt---ttcgttagaatattagtggg--agatattcgaacccgcccaccacatttctcttcagaatttgatttat-tatgtttctgaat-tgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA
                      || |  |||||   |   | | | |   | | | |||   |  ||||  |   |  |  | || ||   |||   | ||  ||| |  ||||| | | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| 
gtaagtctctcattatactctctactcattgttggctcattacataaatgtttcaatggactaattatttaa---cagcttcaaccttcagctttttagttaaattgaaatatgtgtgtaaatctgcagGCTTCCCGGTGACTATGGCTTTGATCCACTCGGACTAGGCAAGGACCCAGCATTCCTCAAGTGGTACAGGGAAGCCGAGCTGATCCACGGGCGATGGGCC

upper sequence: GLYMA08G19210.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
lower sequence: EFJ09339 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 1
tattagttgttatttttcgttagaatattagtgggagatattcgaacccgcccaccacatttctcttcagaatttgatttattatgtttctgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA
                                            |  |     | | | |||||  ||    |    ||| | | |  |    | |||||||| || || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| 
-----------------------------------------gtaagtcttgttatc-cttttctagtctcg-tagagtttctgaggagtgatgaatgcagGCTCCCTGGCGACTATGGTTTTGATCCCCTTGGGCTGGGCAAGGACCCGGCCTTCCTCAAGTGGTACAGAGAAGCGGAGCTCATCCACGGGAGGTGGGCG

upper sequence: GLYMA08G19210.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
lower sequence: EFJ12937 (Selaginella moellendorffii), 3'ss of exon 1
tattagttgttatttttcgttagaatattagtgggagatattcgaacccgcccaccacatt-tctcttcagaatttgatttattatgtttctgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA
                                                 |     |   || ||  ||   | | |  | |       |  ||||| ||||||| || || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| 
-------------------------------------------------gtaagtcttgttatccttttctagtctcgtattgaggaatgatgaat-gcagGCTCCCTGGCGACTATGGTTTTGATCCCCTTGGGCTGGGCAAGGACCCGGCCTTCCTCAAGTGGTACAGAGAAGCGGAGCTCATCCACGGGAGGTGGGCG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192309958|gb|FK000606.1|FK000606
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213593218|gb|DB969904.1|DB969904
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209722039|gb|BW651183.1|BW651183
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|31460390|gb|CD402358.1|CD402358
EST:     AATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: AATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|7691182|gb|AW759314.1|AW759314
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTNTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213604533|gb|DB970653.1|DB970653
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213613734|gb|DB961231.1|DB961231
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213616762|gb|DB971259.1|DB971259
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|31474616|gb|CD416644.1|CD416644
EST:     TCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: TCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|7234755|gb|AW570089.1|AW570089
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209709987|gb|BW653520.1|BW653520
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209719568|gb|BW651020.1|BW651020
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298185442|gb|HO030655.1|HO030655
EST:     GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGG-CTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209714216|gb|BW665529.1|BW665529
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209716833|gb|BW665471.1|BW665471
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213615422|gb|DB965508.1|DB965508
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209711895|gb|BW674159.1|BW674159
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209721310|gb|BW659259.1|BW659259
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|10846346|gb|BF071316.1|BF071316
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|151405615|gb|EV275429.1|EV275429
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAGCCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213607169|gb|DB957089.1|DB957089
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298184479|gb|HO029692.1|HO029692
EST:     GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGG-CTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209709824|gb|BW674014.1|BW674014
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|17518746|gb|BM187788.1|BM187788
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGTAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209712590|gb|BW684154.1|BW684154
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|5606953|gb|AI901051.1|AI901051
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|5753203|gb|AI960490.1|AI960490
EST:     GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCA-AATTGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAAT-GGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213587620|gb|DB971343.1|DB971343
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|6134041|gb|AW132370.1|AW132370
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209705507|gb|BW673528.1|BW673528
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|23052685|gb|BU577177.1|BU577177
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|192298209|gb|FG991699.1|FG991699
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|31307851|gb|CD393054.1|CD393054
EST:     ACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: ACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213618164|gb|DB965321.1|DB965321
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209722544|gb|BW682642.1|BW682642
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|9900181|gb|BE609149.1|BE609149
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209716009|gb|BW668596.1|BW668596
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCC
EST: gi|213611658|gb|DB969046.1|DB969046
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCCTTGGGAAGGACCCAG
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCC-TTGGGAAGGACCCAG
EST: gi|10847280|gb|BF069987.1|BF069987
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298173891|gb|HO017227.1|HO017227
EST:     GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGG-CTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298168264|gb|HO014439.1|HO014439
EST:     GTGTTAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAAT-GGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213617053|gb|DB961533.1|DB961533
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|120530947|gb|EH259080.1|EH259080
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|7232990|gb|AW568341.1|AW568341
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|5509167|gb|AI855725.1|AI855725
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209714932|gb|BW682097.1|BW682097
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213600846|gb|DB958424.1|DB958424
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGAACCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|105632500|gb|DW246443.1|DW246443
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|31456732|gb|CD398760.1|CD398760
EST:     AACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGCCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: AACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213601380|gb|DB956686.1|DB956686
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213596502|gb|DB960291.1|DB960291
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|5510175|gb|AI856559.1|AI856559
EST:     GTGTCAGAGGTGGGTG-CAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGG-TGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|16105379|gb|BI893119.1|BI893119
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209714217|gb|BW665530.1|BW665530
EST:     TCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTT-GGAAGGGACCCAG
genomic: TCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAA-GGACCCAG
EST: gi|9259038|gb|BE347185.1|BE347185
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298181214|gb|HO022653.1|HO022653
EST:     GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAAT-GGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213591847|gb|DB973412.1|DB973412
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|151394779|gb|EV264650.1|EV264650
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|6724344|gb|AW308743.1|AW308743
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213600532|gb|DB960080.1|DB960080
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213587760|gb|DB955622.1|DB955622
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209703696|gb|BW656853.1|BW656853
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209709682|gb|BW657211.1|BW657211
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|13311844|gb|BG405495.1|BG405495
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209728778|gb|BW655446.1|BW655446
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209714358|gb|BW677058.1|BW677058
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|7326905|gb|AW620703.1|AW620703
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213595797|gb|DB955945.1|DB955945
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213587635|gb|DB971358.1|DB971358
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTAT
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTAT
EST: gi|209724862|gb|BW672645.1|BW672645
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|151393648|gb|EV263523.1|EV263523
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298182012|gb|HO026187.1|HO026187
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|10234704|gb|BE803592.1|BE803592
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213601094|gb|DB964629.1|DB964629
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|7692782|gb|AW760881.1|AW760881
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298171066|gb|HO016098.1|HO016098
EST:     GGCGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGA-CCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213617679|gb|DB959347.1|DB959347
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209703026|gb|BW656070.1|BW656070
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|22541690|gb|BU091533.1|BU091533
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|120533781|gb|EH261914.1|EH261914
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213598045|gb|DB972233.1|DB972233
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209706523|gb|BW667800.1|BW667800
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|298172202|gb|HO021794.1|HO021794
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209726500|gb|BW662838.1|BW662838
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGCCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|7030368|gb|AW460151.1|AW460151
EST:     GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTGCGT-GACCCAAAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAAC
genomic: GTGTCAGAGGTGGTGGCAACCT-CGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213607262|gb|DB957126.1|DB957126
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|31469657|gb|CD411685.1|CD411685
EST:     CTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: CTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|213616630|gb|DB971197.1|DB971197
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|20812488|gb|BQ296966.1|BQ296966
EST:     GGTGTCAGAGGTCGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209699075|gb|BW652868.1|BW652868
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
EST: gi|209718688|gb|BW674778.1|BW674778
EST:     GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATC                         GCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC
genomic: GGTGTCAGAGGTGGTGGCAACCTCGTCGACCCAGAATGGCTTGATGGATCgtgagtccac ... tgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

acccgcccaccacatttctcttcagaatttgatttattatgtttctgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA
                          atttgat  putative branch site (score: 5)
                                       tgtttct  putative PPT
                       agaatttgatttatta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tattagttgttatttttcgttagaatattagtgggagatattcgaacccgcccaccacatttctcttcagaatttgatttattatgtttctgaattgcagGCTACCAGGTGACTATGGCTTTGACCCACTAGGCCTTGGGAAGGACCCAGCATTCCTCAAATGGTACAGAGAAGCTGAGCTGATTCATGGGAGATGGGCA

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - gtgggag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cccgccc