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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatcatccagaggcggcgggcccgatgatacgcggagataccttacggttattcgcacccttttgtcatccagAGGCGGCGGGCCCAATGACAAGCAGAGACCAAGTTTGGTCATTCTGCACCCTTGTATCATCCAGAGGCGGCGGGCCCGATGATACGCGGAGACACCTTAC

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA0021S00660.1
intron # 18
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ggcccgatgatacgcggagataccttacggttattcgcacccttttgtcatccagAGGCGGCGGGCCCAATGACAAGCAGAGACCAAGTTTGGTCATTCTGCACCCTTGTATCATCCAGAGGCGGCGGGCCCGATGATACGCGGAGACACCTTAC
                     accttac  putative branch site (score: 3)
                                       cccttttgtcatcc  putative PPT
                              ttatt  TA-rich tract