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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaggtcttggctattgcagcccgcctgtcctgccatggccagatccgcgagtgaagcggcccctgcagctgaccttccccctccacagtctcagtctcggctttgagctcaatggaaatcaggggagtcaagtccctgtccccaattcctggagccgctcacttgcccgcccgcagGACGACCTGCGCTCAGAGGCGTCCTTCGGCAGCCGCGCCGGCGGCGCCACACGTGTGTGCAGGG

Basic information

species Chlamydomonas reinhardtii
transcript EDP08080
intron # 11
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ggggagtcaagtccctgtccccaattcctggagccgctcacttgcccgcccgcagGACGACCTGCGCTCAGAGGCGTCCTTCGGCAGCCGCGCCGGCGGCGCCACACGTGTGTGCAGGG
                                  cgctcac  putative branch site (score: 3)
                                        cttgccc  CT-rich tract