1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
CTTCGGGGCGGGGTCGTGGCTGCGGCACTTCCTTTATTCCCGCCTGGCCACCGAGGAGCTTGCGGAGGTGCATGCCAAGATTTATGGCGGCATGGCCCATgtacgtgagaatattattcaacagctgcatattaaaatccgctcacttacaagccaacataagtatgaacagctcatccagaaccattcagaattaatca...
species | Chlamydomonas reinhardtii |
transcript | EDP01061 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTTCGGGGCGGGGTCGTGGCTGCGGCACTTCCTTTATTCCCGCCTGGCCACCGAGGAGCTTGCGGAGGTGCATGCCAAGATTTATGGCGGCATGGCCCATgtacgtgagaatattattcaacagctgcatattaaaatccgctcacttacaagccaacataagtatgaacagctcatccagaaccattcagaattaatca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgagaat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - caacagc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tgcatat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cacttac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aagccaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -taagtat
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tcatcca