Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...ctgcatgtctgtttagtagcttagtatgtgatcattgttttgctgctgctgaacaatgttttgtcaagagttgatgttgagataaatccttgtaggacagGATGATGCATCGCAAGTTCTCCTGTTAGCTACCGTATGGATTATGATTTTCTTATTTGGTAGTTCGGCATGTGTTTTACCCACGATATATGGCGTCGGCC

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G59400.2
intron # 3
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ctgctgaacaatgttttgtcaagagttgatgttgagataaatccttgtaggacagGATGATGCATCGCAAGTTCTCCTGTTAGCTACCGTATGGATTATGATTTTCTTATTTGGTAGTTCGGCATGTGTTTTACCCACGATATATGGCGTCGGCC
                       agttgat  putative branch site (score: 5)
                                         tccttgt  putative PPT
         aatgtttt  TA-rich tract