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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaattttcagtctttctctgtatgttcttagatttttcagagttcaatgttgcgtttatggttggagattgtagtgtttagtttcattattct...

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT3G55750.1
intron # 2
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|163987936|gb|ES080085.1|ES080085
EST:     GTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: GTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044940|gb|DR340695.1|DR340695
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044990|gb|DR340745.1|DR340745
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044991|gb|DR340746.1|DR340746
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044982|gb|DR340737.1|DR340737
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044930|gb|DR340685.1|DR340685
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044951|gb|DR340706.1|DR340706
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044933|gb|DR340688.1|DR340688
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTAC---AG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86080201|gb|DR375958.1|DR375958
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044999|gb|DR340754.1|DR340754
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044984|gb|DR340739.1|DR340739
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|164204590|gb|ES043137.1|ES043137
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGCTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACC
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACC
EST: gi|86044932|gb|DR340687.1|DR340687
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044959|gb|DR340714.1|DR340714
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044937|gb|DR340692.1|DR340692
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044978|gb|DR340733.1|DR340733
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045009|gb|DR340764.1|DR340764
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044942|gb|DR340697.1|DR340697
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044938|gb|DR340693.1|DR340693
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045007|gb|DR340762.1|DR340762
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044939|gb|DR340694.1|DR340694
EST:     WTTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045026|gb|DR340781.1|DR340781
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|116416174|gb|EG458766.1|EG458766
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044980|gb|DR340735.1|DR340735
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045006|gb|DR340761.1|DR340761
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044954|gb|DR340709.1|DR340709
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045004|gb|DR340759.1|DR340759
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044960|gb|DR340715.1|DR340715
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATDCCCTAACACTTCTCTMGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045017|gb|DR340772.1|DR340772
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045008|gb|DR340763.1|DR340763
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044963|gb|DR340718.1|DR340718
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044966|gb|DR340721.1|DR340721
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044992|gb|DR340747.1|DR340747
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044953|gb|DR340708.1|DR340708
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044924|gb|DR340679.1|DR340679
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATT-AAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045014|gb|DR340769.1|DR340769
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTGACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044958|gb|DR340713.1|DR340713
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044998|gb|DR340753.1|DR340753
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045032|gb|DR340787.1|DR340787
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045012|gb|DR340767.1|DR340767
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044968|gb|DR340723.1|DR340723
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044925|gb|DR340680.1|DR340680
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGWACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044987|gb|DR340742.1|DR340742
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045019|gb|DR340774.1|DR340774
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044943|gb|DR340698.1|DR340698
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044961|gb|DR340716.1|DR340716
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|47828805|gb|CK118489.1|CK118489
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86044988|gb|DR340743.1|DR340743
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
EST: gi|86045005|gb|DR340760.1|DR340760
EST:     ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAG                         GTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
genomic: ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaa ... aatgtttcagGTCCAAGTCGAACCAATACCCTAACACTTCTCTCGTCCAGATTGAAGGTGT
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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ATTGTATGTTCGTGGAACAGTCCTCGGTTACAAGAGgtactttcaattttcagtctttctctgtatgttcttagatttttcagagttcaatgttgcgtttatggttggagattgtagtgtttagtttcattattct

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