1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaggttaactatttttttgctctcctctttcgatttcactatttacggttgattttgagatatttggattgatttatggtaattgaacatagttcctcgatttttgtactgggaattttggtaaccttgataattgatttgaatcaagtcgtgttggtcgcaatctaatgtttcaattgttgtggtgcagACTCGGTATGTGATGAAGTATAGACACTGTGACGGCAAGTTGGTTCTTAAGGTTACTGATAACAAAGAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G49100.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACGAATTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTTCGAGCTGATCCGGAATCT ACTCGGTATGTGATGAAGTATAGACACTGTGACGGCAAGTTGGTTCTTAAGEST: gi|19875150|gb|AU235981.1|AU235981
genomic: ACGAATTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTTCGAGCTGATCCGGAATCTgtaggttaac ... tgtggtgcagACTCGGTATGTGATGAAGTATAGACACTGTGACGGCAAGTTGGTTCTTAAG
EST: ACGAATTCGTTGATCGATCTGTTCAGCTTTTTCGAGCTGATCCGGAATCT ACTCGGTATGTGATGAAGTATAGACACTGTGACGGCAAGTTGGTTCTTAAG
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gatttgaatcaagtcgtgttggtcgcaatctaatgtttcaattgttgtggtgcagACTCGGTATGTGATGAAGTATAGACACTGTGACGGCAAGTTGGTTCTTAAGGTTACTGATAACAAAGAG
atctaat putative branch site (score: 3)
aatctaat TA-rich tract