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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttgtctaatcttgttggtttgtttcacttatggaagcagaatagagagtagatgtgtcaaaaagtgtttgcttattattgttcccgtcttaaaacagATATGCAGAACACAACGATCCTTCAAACACTTGATCAACCTAGCGAAGAACTCTCATCCATTTGGGCTTTGATGCCATCACTATCACCAAAGACTGAGCA

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT1G28320.1
intron # 13
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

agagagtagatgtgtcaaaaagtgtttgcttattattgttcccgtcttaaaacagATATGCAGAACACAACGATCCTTCAAACACTTGATCAACCTAGCGAAGAACTCTCATCCATTTGGGCTTTGATGCCATCACTATCACCAAAGACTGAGCA
                                      ttcccgtctt  CT-rich tract
                             ttattattgtt  TA-rich tract