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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTATGAAGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcgagcttttgaaacctagtgttttaatttttatgaaggcaaaggcattgtgatattaacatgtttgtgtaacttctaagggaatgtagtatct...

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G01820.1
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|7685788|gb|AW756436.1|AW756436
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208240285|gb|GE040911.1|GE040911
EST:     AGTTTAGTAAATAACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGTTT-GTAAAT-ACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193457688|gb|FK424980.1|FK424980
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|16347802|gb|BI973397.1|BI973397
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208169263|gb|GD970920.1|GD970920
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|209718584|gb|BW674723.1|BW674723
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|308098808|gb|HO760649.1|HO760649
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|213613771|gb|DB961268.1|DB961268
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|207775299|gb|GD750300.1|GD750300
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193391542|gb|FK356119.1|FK356119
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208278564|gb|GE076243.1|GE076243
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193377114|gb|FK342751.1|FK342751
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208296783|gb|GE095693.1|GE095693
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAA
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAA
EST: gi|209701913|gb|BW664567.1|BW664567
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193316002|gb|FK280724.1|FK280724
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|213596787|gb|DB964078.1|DB964078
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208110274|gb|GD907306.1|GD907306
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAAT
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAAT
EST: gi|298194838|gb|HO043310.1|HO043310
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAAAGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|298198107|gb|HO039646.1|HO039646
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGACTGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|298167695|gb|HO012958.1|HO012958
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193588046|gb|FK539189.1|FK539189
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208257921|gb|GE050952.1|GE050952
EST:     GTAAATACGGAAGGAG                         GAACGTAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACA
genomic: GTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACG-AATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACA
EST: gi|208191744|gb|GD991062.1|GD991062
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208269029|gb|GE068162.1|GE068162
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAACGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193411626|gb|FK381617.1|FK381617
EST:     CTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: CTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208106673|gb|GD905622.1|GD905622
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193717561|gb|FK650341.1|FK650341
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|207847941|gb|GD819610.1|GD819610
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|22540736|gb|BU090579.1|BU090579
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208306351|gb|GE104430.1|GE104430
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTT-GTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCTAATGTAGTGGTGCTAACA
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCC-AATGTAGTGGTGCTAACA
EST: gi|193499450|gb|FK460363.1|FK460363
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGC
EST: gi|298163482|gb|HO012215.1|HO012215
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|151396040|gb|EV265917.1|EV265917
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|9440203|gb|BE440712.1|BE440712
EST:     GCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: GCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193670121|gb|FK613183.1|FK613183
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACNC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|213587217|gb|DB965921.1|DB965921
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|151397387|gb|EV267260.1|EV267260
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208143785|gb|GD942886.1|GD942886
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|207783866|gb|GD756846.1|GD756846
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|208031357|gb|GD827085.1|GD827085
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCCTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|6746823|gb|AW317279.1|AW317279
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|151406560|gb|EV276375.1|EV276375
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|193415139|gb|FK378405.1|FK378405
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|298195370|gb|HO039201.1|HO039201
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
EST: gi|209711953|gb|BW679032.1|BW679032
EST:     AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAG                         GAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC
genomic: AGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcga ... ttgcttgcagGAACGAATGTAAAGATTGCTACAGTTCCTTCCAATGTAGTGGTGCTAACAC

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTATGAAGGGCCACGCACTGCTGAATCACTTGTTGAGTTTGTAAATACGGAAGGAGgtactctcgagcttttgaaacctagtgttttaatttttatgaaggcaaaggcattgtgatattaacatgtttgtgtaacttctaagggaatgtagtatct

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAG