1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
AGCAGTGGAGTATCCATGCCCGTTTTGCGCAAGTGATTATGATTTAGTTGAATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaattcacttcctatctctcctgctcttttcatttcacactcaagcttcacatgaagcagttttacacagcttagttattcggattgtgggaaa...
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G02750.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGG ATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATAEST: gi|124954213|gb|EL029327.1|EL029327
genomic: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaat ... gtttttgtagATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATA
EST: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGG ATATGTCCTGTATGEST: gi|86088347|gb|DR384106.1|DR384106
genomic: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaat ... gtttttgtagATATGTCCTGTATG
EST: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGG ATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATAEST: gi|86069469|gb|DR365226.1|DR365226
genomic: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaat ... gtttttgtagATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATA
EST: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGG ATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATAEST: gi|19878833|gb|AU239664.1|AU239664
genomic: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaat ... gtttttgtagATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATA
EST: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGG ATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATAEST: gi|125173376|gb|EL194991.1|EL194991
genomic: AATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaat ... gtttttgtagATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATA
EST: GTCATGAAGCTAACAATGGG ATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATA
genomic: GTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaat ... gtttttgtagATATGTCCTGTATGTAGCAAAAGGGTGAAGATGCATATGGTGGATCATATA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AGCAGTGGAGTATCCATGCCCGTTTTGCGCAAGTGATTATGATTTAGTTGAATTGTGTCACCATATCGACGAAGAACATCGTCATGAAGCTAACAATGGGgtttgtgaattcacttcctatctctcctgctcttttcatttcacactcaagcttcacatgaagcagttttacacagcttagttattcggattgtgggaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctatctct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cctgctct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tcacactc