1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...ctagacggtgatcaagttgcttgttgtcgttggtattcaatcaacctcagggactcttgttcttaagtgataagctaattgctatgtgatatgaatgcagATAATGGCCGAGGTACAGACTTTGGTGATTCAAACAGTGATTCTTAAGGTAGTTCTTCATTGCGAGGGATGTGCTCGGACTGTCAAGCGAGCTGTCAAGC
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S93_56V6.6 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGAATCGTATTCTATTACTTCCCACCTATTACGAAGA-TTTATACACAA ATAATGGCCGAGGTACAGACTTTGGTEST: gi|100449999|gb|CJ974043.1|CJ974043
genomic: CAGAATCGTATTCTATTACTTCCCACCTAT-ACGAAGAATTTATACACAAgtactgcttc ... atgaatgcagATAATGGCCGAGGTACAGACTTTGGT
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ctcagggactcttgttcttaagtgataagctaattgctatgtgatatgaatgcagATAATGGCCGAGGTACAGACTTTGGTGATTCAAACAGTGATTCTTAAGGTAGTTCTTCATTGCGAGGGATGTGCTCGGACTGTCAAGCGAGCTGTCAAGC
agctaat putative branch site (score: 3)
atatgaat TA-rich tract