1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtcagttcctttatatgtatccttttttttaccccttgatacggctatgcaaagcatttgctcatgatgtaacaaagctgtttatgatgtcagGTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGATGACGACCATTACAAAAAAGCTTGATATTTTATGTAATCTGAGGAATAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA17G29730.1 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAA GTTGTCGTTGAAGGCTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGAEST: gi|51336058|gb|CO979924.1|CO979924
genomic: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAAgtcagttcct ... atgatgtcagGTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGA
EST: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAA GTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGAEST: gi|208084623|gb|GD885021.1|GD885021
genomic: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAAgtcagttcct ... atgatgtcagGTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGA
EST: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAA GTTGTCGTTGAAGGCTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGAEST: gi|193409056|gb|FK372430.1|FK372430
genomic: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAAgtcagttcct ... atgatgtcagGTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGA
EST: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAA GTTGTCGTTGAAGGCTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGA
genomic: CATGTTGATGAACTATCACGGGAGCTCAAGCTTCCAATGGAAAAGATCAAgtcagttcct ... atgatgtcagGTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGA
atacggctatgcaaagcatttgctcatgatgtaacaaagctgtttatgatgtcagGTTGTCGTTGAAGACTCTTGCAGATGATGGAGAAATATACTCCACCATAGATGACGACCATTACAAAAAAGCTTGATATTTTATGTAATCTGAGGAATAT
atgtaac putative branch site (score: 3)
tttatgat TA-rich tract