1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
taagataactaaatttcttataagaagaatccgtttctttctctttatgattaacatatactaatctcaaatcatatgtaataatgaaacatggttggctcatgcaggAAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACTGGTTTCCTTGTGTGTCTCCCATCTCGTCTTCTATCGGAGTTGATTCCTA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA18G11630.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATCTTGGAGTTCTGGCCGTGCCATCGATGCCCTTGATACATTACTTGATG AAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACTEST: gi|58019358|gb|CX706100.1|CX706100
genomic: ATCTTGGAGTTCTGGCCGTGCCATCGATGCCCTTGATACATTACTTGATGtaagataact ... ctcatgcaggAAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACT
EST: ATCTTGGAGTTCTGGCCGTGCCATCGATGCCCTTGATACATTACTTGATG AAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACTEST: gi|58016320|gb|CX703062.1|CX703062
genomic: ATCTTGGAGTTCTGGCCGTGCCATCGATGCCCTTGATACATTACTTGATGtaagataact ... ctcatgcaggAAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACT
EST: ATCTTGGAGTTCTGGCCGTGCCATCGATGCCCTTGATACATTACTTGATG AAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACT
genomic: ATCTTGGAGTTCTGGCCGTGCCATCGATGCCCTTGATACATTACTTGATGtaagataact ... ctcatgcaggAAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACT
acatatactaatctcaaatcatatgtaataatgaaacatggttggctcatgcaggAAGGACTTGCAATGATTGATGATGGCGATAAAGATGGCAGACGGCGGTACTGGTTTCCTTGTGTGTCTCCCATCTCGTCTTCTATCGGAGTTGATTCCTA
tactaat putative branch site (score: 1)
aaatcatatgtaataa TA-rich tract