1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtaatttaacaatatttgttttacacatttggccataataacttaatcaaattgctaaactcccttaataactgagtttcaccactcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGATCAATTACTTGCTAGAGAAAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA09G30910.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|208218049|gb|GE017873.1|GE017873
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|213619687|gb|DB965633.1|DB965633
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|193500052|gb|FK463933.1|FK463933
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|208291083|gb|GE081551.1|GE081551
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|193383973|gb|FK351378.1|FK351378
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAA-TTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGCGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|208211522|gb|GE014025.1|GE014025
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAAEST: gi|193363574|gb|FK331298.1|FK331298
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAA
EST: TTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTAACCAAEST: gi|193709892|gb|FK642142.1|FK642142
genomic: TTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTT--CCAA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAAGGTAGTAGCATACTACAAEST: gi|193389816|gb|FK353581.1|FK353581
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAA-GGT-GTAGCATACTACAA
EST: AATTTTGATGCCTTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|193660704|gb|FK606428.1|FK606428
genomic: AATTTTGATGCC-TACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|192332517|gb|FK025622.1|FK025622
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|298166439|gb|HO009878.1|HO009878
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|208117295|gb|GD918209.1|GD918209
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|207745315|gb|GD715417.1|GD715417
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|209718599|gb|BW674725.1|BW674725
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGAEST: gi|208092374|gb|GD885491.1|GD885491
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
EST: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAA ATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
genomic: GAATTTTGATGCCTACCGGTTCTCAATCTCGTGGTCCAGAATTTTTCCAAgtaatttaac ... actcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGA
taacttaatcaaattgctaaactcccttaataactgagtttcaccactcctacagATGGAACTGGCCAAGTAAATTGGAAAGGTGTAGCATACTACAATAGGTTGATCAATTACTTGCTAGAGAAAG
taataac putative branch site (score: 1)
ccactcct putative PPT
taatcaaatt TA-rich tract