ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

Select a species and type of splice site

OR, alternatively, select a gene name

atgc highly conserved terminal intronic nucleotides at 5' or 3' end.

atgc branch site.



#1
gene: GRMZM5G820727, transcript: GRMZM5G820727_T01
Orthologs: AT4G25770  GLYMA06G25620  GLYMA04G20400  LOC_Os08g34750  SELMODRAFT_124920  SELMODRAFT_107416  Vv11s0052g01660  
TGCTAATGCTAATTTTGACCgtatcctttaacagcttcatccttgtctgtgtactaattattaatgctgagttacacttcttacctctgacgtgtttccagttaactaagcaaacagATATGGTTGGATGGAGAACA



#2
gene: GRMZM5G820727, transcript: GRMZM5G820727_T02
Orthologs: AT4G25770  GLYMA06G25620  GLYMA04G20400  LOC_Os08g34750  SELMODRAFT_124920  SELMODRAFT_107416  Vv11s0052g01660  
TGCTAATGCTAATTTTGACCgtatcctttaacagcttcatccttgtctgtgtactaattattaatgctgagttacacttcttacctctgacgtgtttccagttaactaagcaaacagATATGGTTGGATGGAGAACA



#3
gene: GRMZM5G820727, transcript: GRMZM5G820727_T03
Orthologs: AT4G25770  GLYMA06G25620  GLYMA04G20400  LOC_Os08g34750  SELMODRAFT_124920  SELMODRAFT_107416  Vv11s0052g01660  
TGCTAATGCTAATTTTGACCgtatcctttaacagcttcatccttgtctgtgtactaattattaatgctgagttacacttcttacctctgacgtgtttccagttaactaagcaaacagATATGGTTGGATGGAGAACA



#4
gene: GRMZM5G820727, transcript: GRMZM5G820727_T04
Orthologs: AT4G25770  GLYMA06G25620  GLYMA04G20400  LOC_Os08g34750  SELMODRAFT_124920  SELMODRAFT_107416  Vv11s0052g01660  
TGCTAATGCTAATTTTGACCgtatcctttaacagcttcatccttgtctgtgtactaattattaatgctgagttacacttcttacctctgacgtgtttccagttaactaagcaaacagATATGGTTGGATGGAGAACA



#5
gene: GRMZM5G820727, transcript: GRMZM5G820727_T05
Orthologs: AT4G25770  GLYMA06G25620  GLYMA04G20400  LOC_Os08g34750  SELMODRAFT_124920  SELMODRAFT_107416  Vv11s0052g01660  
TGCTAATGCTAATTTTGACCgtatcctttaacagcttcatccttgtctgtgtactaattattaatgctgagttacacttcttacctctgacgtgtttccagttaactaagcaaacagATATGGTTGGATGGAGAACA



#6
gene: GRMZM5G820727, transcript: GRMZM5G820727_T06
Orthologs: AT4G25770  GLYMA06G25620  GLYMA04G20400  LOC_Os08g34750  SELMODRAFT_124920  SELMODRAFT_107416  Vv11s0052g01660  
TGCTAATGCTAATTTTGACCgtatcctttaacagcttcatccttgtctgtgtactaattattaatgctgagttacacttcttacctctgacgtgtttccagttaactaagcaaacagATATGGTTGGATGGAGAACA