ERISdb: a Database of Plant Splice Sites



Select a species and type of splice site




OR, alternatively, select a gene name


 atgc   highly conserved terminal intronic nucleotides at 5' or 3' end.

 atgc   branch site.


#1
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T01
Orthologs: AT1G10417 LOC_Os10g27180
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttatgtcaaaatcatgtcggttgttttctaccttaatgacgttacCTTAATAAAACTTTGTTGGT

#2
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T02
Orthologs: AT1G10417 LOC_Os10g27180
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttatgtcaaaatcatgtcggttgttttctaccttaatgacgttacCTTAATAAAACTTTGTTGGT

#3
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T03
Orthologs: AT1G10417 LOC_Os10g27180
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttat ... gttgttttctaccttaatgacgttaccttaataaaactttgttggtgaagGATTACGCTATTGATAGATT

#4
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T04
Orthologs: AT1G10417 LOC_Os10g27180
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttat ... gttgttttctaccttaatgacgttaccttaataaaactttgttggtgaagGATTACGCTATTGATAGATT

#5
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T05
Orthologs: AT1G10417 LOC_Os10g27180
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttat ... gttgttttctaccttaatgacgttaccttaataaaactttgttggtgaagGATTACGCTATTGATAGATT

#6
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T06
Orthologs: AT1G10417 LOC_Os10g27180
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttatgtcaaaatcatgtcggttgttttctaccttaatgacgttacCTTAATAAAACTTTGTTGGT