ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

Select a species and type of splice site

OR, alternatively, select a gene name

atgc highly conserved terminal intronic nucleotides at 5' or 3' end.

atgc branch site.



#1
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T01
Orthologs: AT1G10417  LOC_Os10g27180  
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttatgtcaaaatcatgtcggttgttttctaccttaatgacgttacCTTAATAAAACTTTGTTGGT



#2
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T02
Orthologs: AT1G10417  LOC_Os10g27180  
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttatgtcaaaatcatgtcggttgttttctaccttaatgacgttacCTTAATAAAACTTTGTTGGT



#3
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T03
Orthologs: AT1G10417  LOC_Os10g27180  
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttat ... gttgttttctaccttaatgacgttaccttaataaaactttgttggtgaagGATTACGCTATTGATAGATT



#4
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T04
Orthologs: AT1G10417  LOC_Os10g27180  
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttat ... gttgttttctaccttaatgacgttaccttaataaaactttgttggtgaagGATTACGCTATTGATAGATT



#5
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T05
Orthologs: AT1G10417  LOC_Os10g27180  
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttat ... gttgttttctaccttaatgacgttaccttaataaaactttgttggtgaagGATTACGCTATTGATAGATT



#6
gene: GRMZM2G390432, transcript: GRMZM2G390432_T06
Orthologs: AT1G10417  LOC_Os10g27180  
TTCAGCCCCATCTGGAAGAAatatccattaactaagtcaataaattgcatatgtttaatcttcagtttatgtcaaaatcatgtcggttgttttctaccttaatgacgttacCTTAATAAAACTTTGTTGGT