ERISdb: a Database of Plant Splice Sites



Select a species and type of splice site




OR, alternatively, select a gene name


 atgc   highly conserved terminal intronic nucleotides at 5' or 3' end.

 atgc   branch site.


#1
gene: GRMZM2G300862, transcript: GRMZM2G300862_T01
GTCAAAAGCCTACATATCAAgtatcccactttcttttccagatgctaagttttagaatacttgtaataatctcaattaatgttgacttgcccgctgtcaaatcagGACGGTGGATGAACTTGGAC

#2
gene: GRMZM2G300862, transcript: GRMZM2G300862_T02
GTCAAAAGCCTACATATCAAgtatcccactttcttttccagatgctaagttttagaatacttgtaataatctcaattaatgttgacttgcccgctgtcaaatcagGACGGTGGATGAACTTGGAC

#3
gene: GRMZM2G300862, transcript: GRMZM2G300862_T03
GTCAAAAGCCTACATATCAAgtatcccactttcttttccagatgctaagttttagaatacttgtaataatctcaattaatgttgacttgcccgctgtcaaatcagGACGGTGGATGAACTTGGAC

#4
gene: GRMZM2G300862, transcript: GRMZM2G300862_T05
GTCAAAAGCCTACATATCAAgtatcccactttcttttccagatgctaagttttagaatacttgtaataatctcaattaatgttgacttgcccgctgtcaaatcagGACGGTGGATGAACTTGGAC

#5
gene: GRMZM2G300862, transcript: GRMZM2G300862_T06
GTCAAAAGCCTACATATCAAgtatcccactttcttttccagatgctaagttttagaatacttgtaataatctcaattaatgttgacttgcccgctgtcaaatcagGACGGTGGATGAACTTGGAC