ERISdb: a Database of Plant Splice Sites



Select a species and type of splice site




OR, alternatively, select a gene name


 atgc   highly conserved terminal intronic nucleotides at 5' or 3' end.

 atgc   branch site.


#1
gene: GRMZM2G075551, transcript: GRMZM2G075551_T01
Orthologs: LOC_Os04g02500 Vv14s0060g00320
CTGGCAAAAATTGCTCAACTgtatccatccatacttaattcaaggattccacaagactattctatgttat ... aggaattgtaggttgtatgtgcagcttggatttccttaatgaagcttcagTGCGGATGCTCATAGGAAGC

#2
gene: GRMZM2G075551, transcript: GRMZM2G075551_T02
Orthologs: LOC_Os04g02500 Vv14s0060g00320
CTGGCAAAAATTGCTCAACTgtatccatccatacttaattcaaggattccacaagactattctatgttat ... aggaattgtaggttgtatgtgcagcttggatttccttaatgaagcttcagTGCGGATGCTCATAGGAAGC

#3
gene: GRMZM2G075551, transcript: GRMZM2G075551_T03
Orthologs: LOC_Os04g02500 Vv14s0060g00320
CTGGCAAAAATTGCTCAACTgtatccatccatacttaattcaaggattccacaagactattctatgttat ... aggaattgtaggttgtatgtgcagcttggatttccttaatgaagcttcagTGCGGATGCTCATAGGAAGC

#4
gene: GRMZM2G075551, transcript: GRMZM2G075551_T04
Orthologs: LOC_Os04g02500 Vv14s0060g00320
CTGGCAAAAATTGCTCAACTgtatccatccatacttaattcaaggattccacaagactattctatgttat ... aggaattgtaggttgtatgtgcagcttggatttccttaatgaagcttcagTGCGGATGCTCATAGGAAGC