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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGGTTTCTCTAGTGGTTACTCAATTCCGCTGCAATATCTCAAAGGCACTTGCTTTAACAAACAGgtacatggtacactagttttactttgatcagtacctgtggaacatatttctgtaagccttttaattatctgggggaaatcttttgtacctacgttatctt...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G044317_T02
intron # 9
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G044317_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 9
lower sequence: LOC_Os07g22400.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 9
GTGGTTTCTCTAGTGGTTACTCAATTCCGCTGCAATATCTCAAAGGCACTTGCTTTAACAAACAGgtacatggtacactagttttactttgatcag--tacctgtggaacatatttc---tgtaagcctt-ttaattatctgg-gggaaatcttttgtacctacgttatctt
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GTTGTTTCGCTTGTGGTTACCCAATTCCGCTGCAATATCTCGAAGGCACTTGTTTTAACAAATAGgtacatggtacaaatgttctactttactctgcctagctacatatcatgtccgggaagtgtgctttcttagttctttgctggaaaaattgttgcactctta-------