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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTCTCCGACACCGCACTGCTCACAACTTCGACACCACTTCCGACTCCGTCGCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAGgtatgtcgcctccgtatgctcctctgtctcatactctcattcattccctccctcttccccttctccttgtcatcccgttttcctcgcgctag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G308570_T02
intron # 8
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|76937118|gb|DV175047.1|DV175047
EST:     GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAG                         GGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
genomic: GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAGgtatgtcgcc ... ctcgcgctagGGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
EST: gi|93283332|gb|EB675596.1|EB675596
EST:     GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAG                         GGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
genomic: GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAGgtatgtcgcc ... ctcgcgctagGGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
EST: gi|78111792|gb|DV530189.1|DV530189
EST:     GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAG                         ----AG--TATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
genomic: GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAGgtatgtcgcc ... ctcgcgctagGGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
EST: gi|149102056|gb|EE287526.2|EE287526
EST:     GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAG                         GGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG
genomic: GCCAGGTCCGCCGCCGGCGAGAGCGCCGCAGTCGCTAGCTCCGTATGCAGgtatgtcgcc ... ctcgcgctagGGTTAGAGTATACAGCTGCAGCGGCGGGTGCTCCTGCCGGTACCGAGTGAG