1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
AATCGTATCCCACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctcttgttgtctatatgagcagcaaaggaaacagtcatagtttactggacagtgtctcttataattttgtagtgctgacttgttgatttatgg...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G146472_T02 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|28930818|gb|CB334179.1|CB334179
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|31363344|gb|CD447701.1|CD447701
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|15214979|gb|BI431119.1|BI431119
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|22542105|gb|BU092543.1|BU092543
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACEST: gi|32841469|gb|CD981150.1|CD981150
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTAC
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|19822219|gb|BQ048243.1|BQ048243
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|166685781|gb|EG103044.1|EG103044
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAANAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|76930615|gb|DV172453.1|DV172453
genomic: CGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|89755184|gb|DY685709.1|DY685709
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: GCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32839619|gb|CD979300.1|CD979300
genomic: GCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATG-CCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|71756347|gb|DR954284.1|DR954284
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|24773481|gb|CA408735.1|CA408735
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32837442|gb|CD977120.1|CD977120
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGNACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|149010217|gb|EE042036.2|EE042036
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: TGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60346152|gb|DN213125.1|DN213125
genomic: TGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32831818|gb|CD971496.1|CD971496
genomic: CAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGGCGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60401473|gb|DN234280.1|DN234280
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60343821|gb|DN210794.1|DN210794
genomic: CAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|149101883|gb|EE187954.2|EE187954
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|15632650|gb|BI679743.1|BI679743
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60350971|gb|DN217944.1|DN217944
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|24774011|gb|CA409265.1|CA409265
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGCGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|76918295|gb|DV167234.1|DV167234
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|56462114|gb|CK986412.1|CK986412
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|31356464|gb|CD440821.1|CD440821
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|4753393|gb|AI657303.1|AI657303
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60345407|gb|DN212380.1|DN212380
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|31359395|gb|CD443752.1|CD443752
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|148933612|gb|EC877493.2|EC877493
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|24774111|gb|CA409365.1|CA409365
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|67031337|gb|CO460086.1|CO460086
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60357376|gb|DN224349.1|DN224349
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: GTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|14202293|gb|BG835970.1|BG835970
genomic: GTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|24961547|gb|CA483556.1|CA483556
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|31363502|gb|CD447859.1|CD447859
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAAAGTGGGEST: gi|60396096|gb|DN228965.1|DN228965
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: GCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|31354397|gb|CD438754.1|CD438754
genomic: GCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|24773581|gb|CA408835.1|CA408835
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|29577050|gb|CB617162.1|CB617162
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAAGCAGGGGAAGAA GCATGAGCAATGGGCCCCCTCCACCTGCTTATGEST: gi|148939817|gb|EC884519.2|EC884519
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|211501106|gb|FL128526.1|FL128526
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60355626|gb|DN222599.1|DN222599
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32829344|gb|CD969022.1|CD969022
genomic: CGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60344926|gb|DN211899.1|DN211899
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60337039|gb|DN204012.1|DN204012
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: TGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32839644|gb|CD979325.1|CD979325
genomic: TGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACEST: gi|32839779|gb|CD979460.1|CD979460
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAAC
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|60350068|gb|DN217041.1|DN217041
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: AGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|148942045|gb|EC887040.2|EC887040
genomic: AGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|31364520|gb|CD448875.1|CD448875
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32839780|gb|CD979461.1|CD979461
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|149101884|gb|EE287439.2|EE287439
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGGEST: gi|32839645|gb|CD979326.1|CD979326
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
EST: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAG GCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
genomic: CACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctc ... atgtgcacagGCATGAGCAATGGCCCCCCTCCACCTGCTTATGGTTACAACGAAGAGTGGG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AATCGTATCCCACTGGTCGTGGAAGAGGACGTGGTGGTGGCAGAAGAGGCAGGGGAAGAGgtatgttctcttgttgtctatatgagcagcaaaggaaacagtcatagtttactggacagtgtctcttataattttgtagtgctgacttgttgatttatgg
- - - - - - - - - TGGAAG
- - - - - - - - - - GGAAGA
- - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAAGA