1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
AAAATTATCGAATATCTGAGGAAGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaagatgttgaataggttgcttgctttgctattggtttgactgtctgaccattttatgtctttag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G133757_T01 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTAEST: gi|33095887|gb|CF055881.1|CF055881
genomic: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
EST: GGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTAEST: gi|74237045|gb|DT644959.1|DT644959
genomic: GGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
EST: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTAEST: gi|76289048|gb|DV028616.1|DV028616
genomic: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
EST: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTAEST: gi|60339490|gb|DN206463.1|DN206463
genomic: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
EST: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTAEST: gi|71443366|gb|DR824416.1|DR824416
genomic: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
EST: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTAEST: gi|60401226|gb|DN234033.1|DN234033
genomic: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
EST: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCT GACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
genomic: AGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaa ... atgtctttagGACCTTGTTGAACATAATCCACTTATAGCTGTCGATGTTCTTTCAAAGCTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AAAATTATCGAATATCTGAGGAAGGATGGGAAGCTACTTAATCATTGTGGAATGACACCACAGAAGCTCCCTgtatgtgcaagatgttgaataggttgcttgctttgctattggtttgactgtctgaccattttatgtctttag
- - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGC