1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
CATTGCCAACCTAGCTGGGAACAAGCAGTTAGTGTTGCCTGTCCCTGCATTCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccctcaaccaagatttaacattctttcttgtttgagttttttcgcattatgtttatgctctttccatggatgcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G048371_T01 |
intron # | 8 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|5555521|gb|AI881472.1|AI881472
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|60340424|gb|DN207397.1|DN207397
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|6021395|gb|AW066323.1|AW066323
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|29130133|gb|CB380837.1|CB380837
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTEST: gi|67011307|gb|CO440056.1|CO440056
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|211377302|gb|FL186755.1|FL186755
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|33095703|gb|CF055697.1|CF055697
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTEST: gi|22491087|gb|BU051010.1|BU051010
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTT
EST: TCAATGTCATCAACGGNGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCEST: gi|211435197|gb|FK988707.1|FK988707
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGC
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCATGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGEST: gi|61118137|gb|DN559098.1|DN559098
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|211377303|gb|FL186756.1|FL186756
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|76294188|gb|DV033756.1|DV033756
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67024050|gb|CO452799.1|CO452799
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|211425250|gb|FL005768.1|FL005768
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: CATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31354997|gb|CD439354.1|CD439354
genomic: CATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|211429985|gb|FK988672.1|FK988672
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTAEST: gi|32919907|gb|CF024719.1|CF024719
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTA
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTEST: gi|67026276|gb|CO455025.1|CO455025
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67023203|gb|CO451952.1|CO451952
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67011056|gb|CO439805.1|CO439805
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31353433|gb|CD437790.1|CD437790
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|22521214|gb|BU080025.1|BU080025
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31359544|gb|CD443901.1|CD443901
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31353535|gb|CD437892.1|CD437892
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67022401|gb|CO451150.1|CO451150
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TGGTTCCCNATGCTGG-AACAANCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|6626409|gb|AW257941.1|AW257941
genomic: TGGTTCCC-ATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCCTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGEST: gi|213179295|gb|FM184302.1|FM184302
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGG
EST: GGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31361447|gb|CD445804.1|CD445804
genomic: GGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|21987719|gb|BQ779247.1|BQ779247
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: CAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67011708|gb|CO440457.1|CO440457
genomic: CAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|87152151|gb|DY396940.1|DY396940
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGEST: gi|28909554|gb|CB330988.1|CB330988
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGATTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTEST: gi|20301520|gb|BQ164463.1|BQ164463
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67030419|gb|CO459168.1|CO459168
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|76281562|gb|DV021130.1|DV021130
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67010780|gb|CO439529.1|CO439529
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67040510|gb|CO466765.1|CO466765
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|28930891|gb|CB334252.1|CB334252
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGGTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGCTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTEST: gi|211131238|gb|FL066390.1|FL066390
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|32809865|gb|CD962099.1|CD962099
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAEST: gi|22521582|gb|BU080393.1|BU080393
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTA
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67021372|gb|CO450121.1|CO450121
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAG-AGGCTATGAAGEST: gi|74234275|gb|DT642189.1|DT642189
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|34391122|gb|CF384350.1|CF384350
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAEST: gi|22819010|gb|BU499100.1|BU499100
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTA
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTEST: gi|32915417|gb|CF020229.1|CF020229
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|29577151|gb|CB617263.1|CB617263
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31351690|gb|CD436047.1|CD436047
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67015783|gb|CO444532.1|CO444532
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|211435185|gb|FK988695.1|FK988695
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: AATGTCATCAAACGGGGGTTCCCATGCTGGAAAACA-GCTTGCTATGCAG GAGGTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTAEST: gi|32909266|gb|CF014078.1|CF014078
genomic: AATGTCATCAA-CGGTGGTTCCCATGCTGGAAA-CAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTA
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGEST: gi|211435191|gb|FK988701.1|FK988701
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67016494|gb|CO445243.1|CO445243
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: GAAACATGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67015750|gb|CO444499.1|CO444499
genomic: GAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|60355296|gb|DN222269.1|DN222269
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|13558380|gb|BG549736.1|BG549736
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67023954|gb|CO452703.1|CO452703
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: CTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|29130656|gb|CB381360.1|CB381360
genomic: CTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTEST: gi|6564073|gb|AW231695.1|AW231695
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGT-CCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31349581|gb|CD433938.1|CD433938
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|14204206|gb|BG837883.1|BG837883
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGG-TCCCATGCTMGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31358035|gb|CD442392.1|CD442392
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAGACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|84980804|gb|DW531153.1|DW531153
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: AAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31353699|gb|CD438056.1|CD438056
genomic: AAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|31350995|gb|CD435352.1|CD435352
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|5296087|gb|AI782962.1|AI782962
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTEST: gi|32864127|gb|CF003809.1|CF003809
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTT
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|211377301|gb|FL186754.1|FL186754
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: CAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAGEST: gi|67038520|gb|CO464838.1|CO464838
genomic: CAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
EST: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAG GAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
genomic: TCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccct ... atggatgcagGAGTTTATGATCCTTCCTACTGGAGCTGCCTCATTTAAGGAGGCTATGAAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CATTGCCAACCTAGCTGGGAACAAGCAGTTAGTGTTGCCTGTCCCTGCATTCAATGTCATCAACGGTGGTTCCCATGCTGGAAACAAGCTTGCTATGCAGgcaataccctcaaccaagatttaacattctttcttgtttgagttttttcgcattatgtttatgctctttccatggatgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT