1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
TTTGCAGTTGGAAGGGGCTATGGTGGTGATAATTATGCGATGGAAGAAGCTGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATGgttagttctgtttagatatgttctgtattgtctttaatatcttcttgctagttgcttataggatcaaatatcatggtatcttagaaagtaattacaccgg...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G142111_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATG AAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAAEST: gi|116814849|gb|EC857465.1|EC857465
genomic: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATGgttagttctg ... ttaattgcagAAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAA
EST: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATG AAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAAEST: gi|32810380|gb|CD962614.1|CD962614
genomic: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATGgttagttctg ... ttaattgcagAAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAA
EST: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATG AAGGTGGCAGGGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAAEST: gi|91874465|gb|EB404422.1|EB404422
genomic: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATGgttagttctg ... ttaattgcagAAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAA
EST: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATG AAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAA
genomic: TGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATGgttagttctg ... ttaattgcagAAGGTGGCAGAGGAAGGGGCAGAGGGCGTGGACGCGGTCGTGGGCGGGGAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TTTGCAGTTGGAAGGGGCTATGGTGGTGATAATTATGCGATGGAAGAAGCTGGTAGATATGATGATGATGGATATAACGCACCACCTATGCAACGATATGgttagttctgtttagatatgttctgtattgtctttaatatcttcttgctagttgcttataggatcaaatatcatggtatcttagaaagtaattacaccgg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gaaagtaa