1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
TGCCAAGTCAAATTATATGTCAGCTGGTCAGATATCTGTTCCTATTGTTTTTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcagatggaattgctcatgtagttatgtaattatgtgtctgattatcatccttctacttcctaatttttcatctttatgttattgccatcctttt...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G097226_T02 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAG TGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCAEST: gi|78122124|gb|DV540508.1|DV540508
genomic: TGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcaga ... ttgtatgcagTGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
EST: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAG TGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCAEST: gi|211317947|gb|FL318710.1|FL318710
genomic: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcaga ... ttgtatgcagTGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
EST: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAG TGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCAEST: gi|32940983|gb|CF045802.1|CF045802
genomic: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcaga ... ttgtatgcagTGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
EST: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAG TGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCAEST: gi|211088145|gb|FL307530.1|FL307530
genomic: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcaga ... ttgtatgcagTGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
EST: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAG TGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCAEST: gi|91057168|gb|EB167586.1|EB167586
genomic: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcaga ... ttgtatgcagTGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
EST: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAG TGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
genomic: TTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcaga ... ttgtatgcagTGTTATGCAGCTTGGTTTGCACATGTTCCAGGACTTAAGGTTCTCACACCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGCCAAGTCAAATTATATGTCAGCTGGTCAGATATCTGTTCCTATTGTTTTTAGAGGACCAAACGGAGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCTCAACACTCACAGgtttgtcagatggaattgctcatgtagttatgtaattatgtgtctgattatcatccttctacttcctaatttttcatctttatgttattgccatcctttt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA