1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
GCAATGTGAACCTCAACACCTTGATGAACATGTTCAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagtacatagtctgttctgttaatgaaaaaaataatcctgcatttccactaagtataatctcttgaagcttttctctttggatgttttttttttgaggttttctcatcaacaaagtaatgtcaaaatttgcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G057158_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGGEST: gi|21828621|gb|BQ703305.1|BQ703305
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGG
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCCCCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGGEST: gi|67027074|gb|CO455823.1|CO455823
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGG
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGGEST: gi|87156460|gb|DY401249.1|DY401249
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGG
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGGEST: gi|113704257|gb|EE681761.1|EE681761
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGG
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGGEST: gi|94473208|gb|EB702166.1|EB702166
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGG
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGGEST: gi|60340529|gb|DN207502.1|DN207502
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAACACAATTAGCTCAGCTCCAAGAAATGG
EST: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATG TGCCACCAGAAGAACTGTATGCAA
genomic: CAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagta ... aaatttgcagTGCCACCAGAAGAACTGTATGCAA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCAATGTGAACCTCAACACCTTGATGAACATGTTCAGTGGGCTTGGTGCTGGTGGTGGCCTAGGTGTTCCAAATGCTCCTAATGgttagtagtacatagtctgttctgttaatgaaaaaaataatcctgcatttccactaagtataatctcttgaagcttttctctttggatgttttttttttgaggttttctcatcaacaaagtaatgtcaaaatttgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG