1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttgttgctgtggcgttattcctttttatgagatttcagttagtctaattcggcagcttgcttatccaggattgcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G024690_T02 |
intron # | 7 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGGGGGATTTGTTTATAAATTATGG AATGCTTTGCATTTCTTGTCTGTACAAGATGGTTTAATCCCATGATTCACAEST: gi|91870315|gb|EB400812.1|EB400812
genomic: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttg ... aggattgcagAATGCTTTGCATTTCTTGTCTGTACAAGATGGTTTAATCCCATGATTCACA
EST: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGG GEST: gi|91870315|gb|EB400812.1|EB400812
genomic: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttg ... aggattgcag-
EST: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGG GEST: gi|78117592|gb|DV535979.1|DV535979
genomic: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttg ... aggattgcag-
EST: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGG GEST: gi|78117592|gb|DV535979.1|DV535979
genomic: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttg ... aggattgcag-
EST: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGG G
genomic: GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttg ... aggattgcag-
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTGATGTTGGTGCTTTGGGATGGTGGGATTTGTTTATAAATTATGGgtgagatttgttgctgtggcgttattcctttttatgagatttcagttagtctaattcggcagcttgcttatccaggattgcag
- - - - - - - - - - TGGTGG