Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatctaatccaagtgtatgaaaccgtggaagtgaaagaactcttcttttttccagttgcagaattgttgtttaacagttggctttcatgatttgtatatccag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G048371_T01
intron # 6
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os10g08550.3 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatctaatccaagtgtatgaaaccgtggaagtgaaagaactcttcttttttccagttgcagaattgttgtttaacagttggctttcatgatttgtatatccag
||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||        | |   ||| |   || |  |   | | ||| ||| |    ||   | ||  |  |  |||| || |    ||| | |||
GACCCTACGTCACAGGCTGAGCTTGATAACTTCATGGTTCAGCAGCTTGATGGAACCAAAAATGAGTGGGGGTGGTGCAAGCAGAAGgtattatctaatccatctggtcatgggcctt--agtcatgaaaattgtagatgtaccatttgtaag--tggattctactaagt--cttttatca---atatgtgcag

upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: Vv16s0022g01770.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 5
GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatctaatccaagtgtatgaaaccgtggaagtga--aagaactcttcttttttccagttgcagaattgttgtttaacagtt--ggctttcatgatttgtatatccag---------------------
||||| ||||  |||  | |||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    ||| | | | ||| |     |    | ||   | | || |||| |||| |  | |  |  ||   | |||  ||  || |||||   |  ||                         
GACCCAACAGAGCAGGTTAAGATCGACAATTTCATGGTGCAACAGCTTGATGGAACAGTTAATGAATGGGGTTGGTGCAAGCAAAAGgtattatataac---agtttttcagaccttaattcttcttatgacagcatattatttcaagtttcttagtgctacttctcctgttttggactttatgatgactggattttttcttcttttcaactatattag

upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: PP1S1_527V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 5
GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtatta--------tctaatccaagtgtatgaaaccg----tggaagtgaaagaactcttcttttttccagttgcagaattgttgtttaacagttggctttcatgatttgtatatccag---------------------------------------------------
||||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| | |         ||    ||| |   ||   | |    ||| ||    | |||       | |   | |    ||  || |    || || || |  ||| || |  | || | ||                                                   
GACCCTACAGATCAAACTGGAATTGACAACTTCATGGTTCATGAACTTGACGGTACCCAGAACGAGTGGGGGTGGTGCAAGCAGAAGgtgtcaatctctggccttgctcaaatcattggtgcagaatttgggagactgataacctggaggtctagaaatcagggatgtgcttaggaatagctgacgatcaggaat-atgtaacgagcacggcttgtggctctatggtctgacaagtatcttacactgtattatgcag

upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: PP1S1_526V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 5
GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtat---tatctaa---tccaagtgtatgaaaccgtggaagtgaaagaactcttcttttttccag--ttgcagaattgttgtttaacagttggctttcatgatttgtatatccag---------------------------------
||||| |||   || ||||  || || ||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||     ||  | || || |   |  | |  ||   ||    ||  | ||||  |  ||   ||| |   |  | |  |   ||   ||||   | |     ||                                  
GACCCCACAAACCAAACTGCAATCGACAACTTCATGGTTCACGAACTTGACGGTACCCAAAACGAGTGGGGATGGTGCAAGCAGAAGgtatcaatatctgggcttctcaatgcattagtaca-gaatttggtggagacattgatctttcaggggttattgaaatcaggaatgatcggcagcaagcatggcgtttggcctcatggtctgactagttccttgtactggattgtgcag

upper sequence: GRMZM2G048371_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: PP1S133_85V6.1 (Physcomitrella patens), 5'ss of exon 5
GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtatta-tctaatccaa-gtgtatgaaacc---gtggaagtgaaagaactcttcttttttccagt-tgcagaattgttgtttaa---------cagttggctttcatgatt---tgtatatccag---------------------------------------------
|||||   ||  || || |  || || ||||| ||||||||  |||| || ||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | | | || |   |   |||| ||    |   || ||   |   ||  |    | || |  | ||||| ||  |  | |         |||||| || |||||| |   ||   ||| |                                              
GACCCCTTAGATCAAACCGCAATCGACAACTTTATGGTTCATGAACTCGACGGAGCAAAGAATGAGTGGGGATGGTGCAAGAAAAAGgtttcaatatgatacgttgctaatgatacttgtgccaaattgggcgtgatccacaacatccctgagttcagaaatgagggatgaactcagcagcagttgactatcatgactggctggcgatcaaagagagacctcatcatttgatgaacattttgttcttttttatgcag

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|67016579|gb|CO445328.1|CO445328
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|5555521|gb|AI881472.1|AI881472
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|18649891|gb|BM498710.1|BM498710
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429978|gb|FK988665.1|FK988665
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435188|gb|FK988698.1|FK988698
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|30031961|gb|CB833812.1|CB833812
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|60340424|gb|DN207397.1|DN207397
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|6021395|gb|AW066323.1|AW066323
EST:     AACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGNGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: AACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|29130133|gb|CB380837.1|CB380837
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432588|gb|FK988689.1|FK988689
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67011307|gb|CO440056.1|CO440056
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432592|gb|FK988693.1|FK988693
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|9952300|gb|BE638883.1|BE638883
EST:     CTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211377302|gb|FL186755.1|FL186755
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|33095703|gb|CF055697.1|CF055697
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|29130740|gb|CB381444.1|CB381444
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|33095727|gb|CF055721.1|CF055721
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22491087|gb|BU051010.1|BU051010
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|6626439|gb|AW257971.1|AW257971
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435197|gb|FK988707.1|FK988707
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432581|gb|FK988682.1|FK988682
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATSGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTT
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTT
EST: gi|61118137|gb|DN559098.1|DN559098
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22489635|gb|BU049558.1|BU049558
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211377303|gb|FL186756.1|FL186756
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|18384419|gb|BM417618.1|BM417618
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCACGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211437781|gb|FK988709.1|FK988709
EST:     TCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGG-ATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|76294188|gb|DV033756.1|DV033756
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67024050|gb|CO452799.1|CO452799
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31354997|gb|CD439354.1|CD439354
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432583|gb|FK988684.1|FK988684
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429985|gb|FK988672.1|FK988672
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|32919907|gb|CF024719.1|CF024719
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|60336913|gb|DN203886.1|DN203886
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|32936327|gb|CF041139.1|CF041139
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429984|gb|FK988671.1|FK988671
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|19351347|gb|BM895879.1|BM895879
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGNGTCATTAGCTGNTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67026276|gb|CO455025.1|CO455025
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCTTGCACAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67023203|gb|CO451952.1|CO451952
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432580|gb|FK988681.1|FK988681
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67011056|gb|CO439805.1|CO439805
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432584|gb|FK988685.1|FK988685
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCANAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAA-GCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31353433|gb|CD437790.1|CD437790
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|29946576|gb|CB816219.1|CB816219
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435186|gb|FK988696.1|FK988696
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22521214|gb|BU080025.1|BU080025
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31359544|gb|CD443901.1|CD443901
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22521261|gb|BU080072.1|BU080072
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31353535|gb|CD437892.1|CD437892
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435184|gb|FK988694.1|FK988694
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|87154039|gb|DY398828.1|DY398828
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|6626409|gb|AW257941.1|AW257941
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429980|gb|FK988667.1|FK988667
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|30031628|gb|CB833479.1|CB833479
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTC-ATTAGCTGTTTGCAAAGCTGG
EST: gi|211429991|gb|FK988678.1|FK988678
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGC
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGC
EST: gi|67011708|gb|CO440457.1|CO440457
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432579|gb|FK988680.1|FK988680
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211437784|gb|FK988712.1|FK988712
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|87152151|gb|DY396940.1|DY396940
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|28909554|gb|CB330988.1|CB330988
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432591|gb|FK988692.1|FK988692
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|20301520|gb|BQ164463.1|BQ164463
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435194|gb|FK988704.1|FK988704
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429987|gb|FK988674.1|FK988674
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67030419|gb|CO459168.1|CO459168
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGCGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429981|gb|FK988668.1|FK988668
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGNCAAAGCTGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTG-CAAAGCTGG
EST: gi|76281562|gb|DV021130.1|DV021130
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67010780|gb|CO439529.1|CO439529
EST:     AAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAA-                         CTTGGCGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: AAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67040510|gb|CO466765.1|CO466765
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|28930891|gb|CB334252.1|CB334252
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAAGCTGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAA-GCTGG
EST: gi|211131238|gb|FL066390.1|FL066390
EST:     TCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGG
genomic: TCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAA-GCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGG
EST: gi|211432586|gb|FK988687.1|FK988687
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGNGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGC
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTG-GTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGC
EST: gi|32809865|gb|CD962099.1|CD962099
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCGAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTAGA
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22521582|gb|BU080393.1|BU080393
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|28576040|gb|CB281932.1|CB281932
EST:     CTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67021372|gb|CO450121.1|CO450121
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|26456226|gb|CA827809.1|CA827809
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|34391122|gb|CF384350.1|CF384350
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429979|gb|FK988666.1|FK988666
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22819010|gb|BU499100.1|BU499100
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435187|gb|FK988697.1|FK988697
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|32915417|gb|CF020229.1|CF020229
EST:     TGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|29577151|gb|CB617263.1|CB617263
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGG-GCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCT-GG
EST: gi|211131241|gb|FL066393.1|FL066393
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435185|gb|FK988695.1|FK988695
EST:     TCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTNGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGT-GGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435193|gb|FK988703.1|FK988703
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435195|gb|FK988705.1|FK988705
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|6964710|gb|AW433403.1|AW433403
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|28909616|gb|CB331015.1|CB331015
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|32909266|gb|CF014078.1|CF014078
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211131242|gb|FL066394.1|FL066394
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435191|gb|FK988701.1|FK988701
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|22546282|gb|BU098593.1|BU098593
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|60355296|gb|DN222269.1|DN222269
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211429983|gb|FK988670.1|FK988670
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|13558380|gb|BG549736.1|BG549736
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|29130656|gb|CB381360.1|CB381360
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|6564073|gb|AW231695.1|AW231695
EST:     CAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: CAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31349581|gb|CD433938.1|CD433938
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|13490673|gb|BG517437.1|BG517437
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211130322|gb|FL066389.1|FL066389
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211432578|gb|FK988679.1|FK988679
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435192|gb|FK988702.1|FK988702
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|32908618|gb|CF013431.1|CF013431
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31358035|gb|CD442392.1|CD442392
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|21987151|gb|BQ778679.1|BQ778679
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|15100536|gb|BI396327.1|BI396327
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31353699|gb|CD438056.1|CD438056
EST:     TTCANNNNNNNGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAATCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|31350995|gb|CD435352.1|CD435352
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|5296087|gb|AI782962.1|AI782962
EST:     GCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTG-CATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: GCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|32864127|gb|CF003809.1|CF003809
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|211435189|gb|FK988699.1|FK988699
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGC
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGC
EST: gi|211131240|gb|FL066392.1|FL066392
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAK                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
EST: gi|67038520|gb|CO464838.1|CO464838
EST:     TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAG                         CTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG
genomic: TTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatcta ... gtatatccagCTTGGTGCTAATGCGATTCTGGCTGTGTCATTAGCTGTTTGCAAAGCTGGG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GACCCTACAGCACAGACTGAGATTGATAACTTCATGGTTCAACAACTTGATGGGACCAAAAATGAGTGGGGATGGTGCAAGCAAAAGgtattatctaatccaagtgtatgaaaccgtggaagtgaaagaactcttcttttttccagttgcagaattgttgtttaacagttggctttcatgatttgtatatccag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA