1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
GCATGCACGGTGGATCTACTGAGTTACAGgtgcgttgctgcgtgtttgtacttgtagctaccagctttatgaggttatgcaaggaacttgacagaagttttgttgcctctactttgtatcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G176506_T07 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: GCATGCACGGTGGATCTACTGAGTTACAG GAAAGATGGAAGTTCATTCTGTGATCATCTACATGTATCTCCTATCCGAGAEST: gi|78080958|gb|DV509370.1|DV509370
genomic: GCATGCACGGTGGATCTACTGAGTTACAGgtgcgttgct ... tttgtatcagGAAAGATGGAAGTTCATTCTGTGATCATCTACATGTATCTCCTATCCGAGA
EST: GCATGCACGGTGGATCTACTGAGTTACAG GAAAGATGGAAGTTCATTCTGTGATCATCTACATGTATCTCCTATCCGAGA
genomic: GCATGCACGGTGGATCTACTGAGTTACAGgtgcgttgct ... tttgtatcagGAAAGATGGAAGTTCATTCTGTGATCATCTACATGTATCTCCTATCCGAGA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCATGCACGGTGGATCTACTGAGTTACAGgtgcgttgctgcgtgtttgtacttgtagctaccagctttatgaggttatgcaaggaacttgacagaagttttgttgcctctactttgtatcag
- - - - GGTGGA