1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
GCATGACTCCTTACATCAACCTTTACCACTATGATCTTCCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagtctaaagatatatctggtcatgttattaacgtgtttcgactttctgtgttttcccgaaagaaggacacacaacatagaatctctagtttcacatgatatagaactggaaataccagattatacttatatatgtatacaatttgttttgtag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G118003_T01 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|87157163|gb|DY401952.1|DY401952
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32848755|gb|CD988436.1|CD988436
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211322178|gb|FK979475.1|FK979475
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CTCTTGCGCTTGAGAAGAA-TATGGAAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GACCEST: gi|32928641|gb|CF033453.1|CF033453
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGA-GGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACC
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|6826935|gb|AW330578.1|AW330578
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|109179241|gb|EC379886.1|EC379886
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211192948|gb|FK979444.1|FK979444
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CTCTTGCGCTTGAGAAGATATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCEST: gi|211192942|gb|FK979438.1|FK979438
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAA-GATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATC
EST: CTCTTGCGCTTGAGA-GAAATATGGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACEST: gi|60397967|gb|DN230783.1|DN230783
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGG-AGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTAC
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|31611947|gb|CD568569.1|CD568569
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211192947|gb|FK979443.1|FK979443
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGANAAGAAATATGGAGGGTGGTTTAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTRTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|148934074|gb|EC878088.2|EC878088
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTEST: gi|149096066|gb|EE181748.2|EE181748
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTT
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|67024539|gb|CO453288.1|CO453288
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211197749|gb|FK979464.1|FK979464
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CTCTTGCGCTTGAGA-GAAATATGGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTT-AAGAACTACGGCGATCGEST: gi|71331060|gb|DR802360.1|DR802360
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGG-AGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|148969028|gb|EE019736.2|EE019736
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32929351|gb|CF034163.1|CF034163
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211322184|gb|FK979481.1|FK979481
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGNANGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GACCEST: gi|22472597|gb|BU037077.1|BU037077
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGA-GGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACC
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211195352|gb|FK979460.1|FK979460
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GAACTACNGCGATCGEST: gi|29543733|gb|CB604113.1|CB604113
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGG-GGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211192936|gb|FK979432.1|FK979432
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CTCTTGCGCTTGAGAA-AAATATGGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GAACTACGEST: gi|32929206|gb|CF034018.1|CF034018
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGG-AGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|148931885|gb|EC877350.2|EC877350
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|21760120|gb|BQ635661.1|BQ635661
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGCNAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|148931067|gb|EC873678.2|EC873678
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACEST: gi|32928537|gb|CF033349.1|CF033349
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|6564100|gb|AW231722.1|AW231722
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|31353887|gb|CD438244.1|CD438244
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|21390100|gb|BQ528149.1|BQ528149
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211192950|gb|FK979446.1|FK979446
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|6636984|gb|AW261256.1|AW261256
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGCTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGNTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|211195346|gb|FK979454.1|FK979454
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAA-TATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GACCTACGGCGATCGEST: gi|28909524|gb|CB330973.1|CB330973
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGEST: gi|32929111|gb|CF033923.1|CF033923
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32848750|gb|CD988431.1|CD988431
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32837200|gb|CD976878.1|CD976878
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTTGTT-ACAGACTATGCTGAEST: gi|148996928|gb|EE035737.2|EE035737
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTT-GTTTACAGACTATGCTGA
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTANGACCTACGGCGATCGEST: gi|67018030|gb|CO446779.1|CO446779
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32929433|gb|CF034245.1|CF034245
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32929642|gb|CF034454.1|CF034454
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGCC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32928848|gb|CF033660.1|CF033660
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGGGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32847307|gb|CD986988.1|CD986988
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32837471|gb|CD977149.1|CD977149
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32929091|gb|CF033903.1|CF033903
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGGAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32849499|gb|CD989180.1|CD989180
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|26558653|gb|CA830888.1|CA830888
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|32928412|gb|CF033224.1|CF033224
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGEST: gi|101393334|gb|EB818598.1|EB818598
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGGGGTTAAGCGCGAAGATGGC GGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GCATGACTCCTTACATCAACCTTTACCACTATGATCTTCCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagtctaaagatatatctggtcatgttattaacgtgtttcgactttctgtgttttcccgaaagaaggacacacaacatagaatctctagtttcacatgatatagaactggaaataccagattatacttatatatgtatacaatttgttttgtag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG