Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctttttaacatctgatgatgtgttgatgtgttgtccgcttattaagtttgagttgcacaatgaacttccctccacttttcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G102596_T01
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G102596_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os06g06030.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
CTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggct----ctttttaacatctgatgatgtgttgatgtgttgtccgcttattaagtttgagttgcacaatgaacttccctccacttttcag
||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |    |||||    | ||  |  | ||||| | || ||   ||||||   || | | || |  | |||||||||     ||||||||
CTGGCTTGTACTATGTTGATAGTGAGGGCGCAAGGCTCATGGGAAGCCGATTCTCTGTTGGATCAGGTTCTCTGTATGCCTATGGTATCTTGGACGAGGGgtaggttttatcttttatttacctccttttatgttgctttgctgcttgcttatactgtgttacttacgta-tgaacttcc----gcttttcag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|22521497|gb|BU080308.1|BU080308
EST:     CTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGC
EST: gi|45568022|gb|CK985863.1|CK985863
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32825185|gb|CD964907.1|CD964907
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|14621502|gb|BI142263.1|BI142263
EST:     GCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: GCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|31355758|gb|CD440115.1|CD440115
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|74235152|gb|DT643066.1|DT643066
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|21331860|gb|BQ487241.1|BQ487241
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCCCTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|149029425|gb|EE286206.2|EE286206
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|148930315|gb|EE284711.2|EE284711
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4388173|gb|AI491345.1|AI491345
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCCAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|22521496|gb|BU080307.1|BU080307
EST:     TTTTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60340648|gb|DN207621.1|DN207621
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCCTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|22473321|gb|BU037801.1|BU037801
EST:     TTTTTTGTTGGCTCTGGTTCCCTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|211255519|gb|FL452747.1|FL452747
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|78111778|gb|DV530175.1|DV530175
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGA
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGA
EST: gi|67024831|gb|CO453580.1|CO453580
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGGAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60396264|gb|DN229133.1|DN229133
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCCTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|76017825|gb|DT944995.1|DT944995
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGGTGAGGAAGCCCCCCAATTAGCG
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCG
EST: gi|60400705|gb|DN233512.1|DN233512
EST:     TCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGAGTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATG-CTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|5058758|gb|AI737234.1|AI737234
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|29945859|gb|CB815856.1|CB815856
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|67021569|gb|CO450318.1|CO450318
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|149102540|gb|EE287897.2|EE287897
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|78091577|gb|DV519951.1|DV519951
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|50325401|gb|CO520527.1|CO520527
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60396648|gb|DN229516.1|DN229516
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|61119780|gb|DN560741.1|DN560741
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|211477744|gb|FL107320.1|FL107320
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|50325400|gb|CO520526.1|CO520526
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|88747941|gb|DY532082.1|DY532082
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|31355177|gb|CD439534.1|CD439534
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60400195|gb|DN233002.1|DN233002
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCCTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|31352712|gb|CD437069.1|CD437069
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71305291|gb|DR788779.1|DR788779
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4647461|gb|AI622536.1|AI622536
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCCCTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|120479865|gb|EH210655.1|EH210655
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4647226|gb|AI622301.1|AI622301
EST:     TTCTCTGTTGGCTGTGGTTCNCTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTNCCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|18383566|gb|BM416766.1|BM416766
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|33102885|gb|CF062845.1|CF062845
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|148948646|gb|EC898560.2|EC898560
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|120480036|gb|EH210702.1|EH210702
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|101388656|gb|EB816314.1|EB816314
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGATTTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|30032157|gb|CB834008.1|CB834008
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|74245089|gb|DT653003.1|DT653003
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|149080432|gb|EE169456.2|EE169456
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|6952787|gb|AW424855.1|AW424855
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCNCTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|40334395|gb|CK368465.1|CK368465
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32863699|gb|CF003381.1|CF003381
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|94472205|gb|EB701163.1|EB701163
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|88756374|gb|DY540515.1|DY540515
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|5058715|gb|AI737191.1|AI737191
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|211492165|gb|FL107401.1|FL107401
EST:     TTMTCTGTTGGCTCTGNTTCACTGTATGCCTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|26457642|gb|CA829225.1|CA829225
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAG
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAG
EST: gi|32925969|gb|CF030781.1|CF030781
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71328531|gb|DR800922.1|DR800922
EST:     TTCTCTGTTGGCTTTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|31351554|gb|CD435911.1|CD435911
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60339639|gb|DN206612.1|DN206612
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|78120600|gb|DV538984.1|DV538984
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32807075|gb|CD959309.1|CD959309
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32827429|gb|CD967107.1|CD967107
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGCCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|76293517|gb|DV033085.1|DV033085
EST:     TTTTCTGTTGGTTTTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGGGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|31354511|gb|CD438868.1|CD438868
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|16925679|gb|BM078747.1|BM078747
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|78111766|gb|DV530163.1|DV530163
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         GTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCG
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCG
EST: gi|149102541|gb|EE287898.2|EE287898
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4775866|gb|AI664871.1|AI664871
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60357179|gb|DN224152.1|DN224152
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32851229|gb|CD990910.1|CD990910
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|166697485|gb|EG296542.1|EG296542
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTC
EST: gi|211477741|gb|FL107317.1|FL107317
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|8401301|gb|BE056935.1|BE056935
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         -TACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|211486402|gb|FL107374.1|FL107374
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|7137959|gb|AW499358.1|AW499358
EST:     GGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: GGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71298844|gb|DR785411.1|DR785411
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4827480|gb|AI668172.1|AI668172
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|21625974|gb|BQ620895.1|BQ620895
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71305289|gb|DR788778.1|DR788778
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|19058235|gb|BM736902.1|BM736902
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32824775|gb|CD964497.1|CD964497
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|69351484|gb|DR452150.1|DR452150
EST:     TGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|93283424|gb|EB675688.1|EB675688
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGAATCTTGGATGATGG                         GTACCGCTTCAGCATGTCAGGTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGA
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGA
EST: gi|40286958|gb|CK327350.1|CK327350
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAG
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAG
EST: gi|148948645|gb|EC898559.2|EC898559
EST:     TTCTCTGTTGGTTTTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|21331351|gb|BQ486732.1|BQ486732
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60356523|gb|DN223496.1|DN223496
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|22542600|gb|BU093038.1|BU093038
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|45567510|gb|CK985606.1|CK985606
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71328533|gb|DR800923.1|DR800923
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|32827549|gb|CD967227.1|CD967227
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|76282580|gb|DV022148.1|DV022148
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71775191|gb|DR973069.1|DR973069
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|37375977|gb|CF624481.1|CF624481
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|101383043|gb|EB813574.1|EB813574
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|45847315|gb|CN071258.1|CN071258
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4753476|gb|AI657386.1|AI657386
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|74235153|gb|DT643067.1|DT643067
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|16925847|gb|BM078915.1|BM078915
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|76293518|gb|DV033086.1|DV033086
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60352355|gb|DN219328.1|DN219328
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCCTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60399148|gb|DN231962.1|DN231962
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|166650171|gb|EG286692.1|EG286692
EST:     GTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTAATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: GTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTT-ATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|213171133|gb|FM189138.1|FM189138
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|67024666|gb|CO453415.1|CO453415
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|74245088|gb|DT653002.1|DT653002
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|74234793|gb|DT642707.1|DT642707
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|71770949|gb|DR968886.1|DR968886
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGGAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|4573344|gb|AI586903.1|AI586903
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCCCTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTNCCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|76282581|gb|DV022149.1|DV022149
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|93283423|gb|EB675687.1|EB675687
EST:     ACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: ACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|9254778|gb|BE345246.1|BE345246
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCAGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|60354395|gb|DN221368.1|DN221368
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|74234792|gb|DT642706.1|DT642706
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|166547972|gb|EG293390.1|EG293390
EST:     CTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: CTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|78120599|gb|DV538983.1|DV538983
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|33104175|gb|CF064135.1|CF064135
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGC
EST: gi|149089315|gb|EE178536.2|EE178536
EST:     TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGG                         TTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAG
genomic: TTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 729

CTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGCTATTTATGGGGCAACATTCCGTGATGCAGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGT


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 387

CTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGCTATTTATGGGGCAACATTCCGTGATGCAGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGT


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 413

CTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGCTATTTATGGGGCAACATTCCGTGATGCAGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGT


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 578

CTGGCTTGTACTATGTTGACAGTGAGGGTGCGCGGCTCGTGGGGAACAGGTTCTCTGTTGGCTCTGGTTCACTGTATGCTTATGGTATCTTGGATGATGGgtaggctctt ... cacttttcagTTACCGCTTCAGCATGTCAGTTGAGGAAGCCGCCGAATTAGCGCGACGGGCTATTTATGGGGCAACATTCCGTGATGCAGCAAGTGGTGGTTGTGTTAGT