1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
TGCTGTTGGCAACTGCGGCATGGATGAGAAGCAGATCTTCCAGAATGTGCAAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcctcacatctgtataaaattaatgcttatgttctaaaatatgactatccactgggctaactgtcatcttgtgtgtttgcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G023748_T01 |
intron # | 5 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|15005408|gb|BI325475.1|BI325475
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|19057556|gb|BM736238.1|BM736238
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|166695057|gb|EG222478.1|EG222478
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCCCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCEST: gi|211036043|gb|FL452225.1|FL452225
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|32945901|gb|CF050720.1|CF050720
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTAEST: gi|60339572|gb|DN206545.1|DN206545
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTA
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|22819514|gb|BU499604.1|BU499604
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|37384022|gb|CF629054.1|CF629054
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCCCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|78083264|gb|DV511657.1|DV511657
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTTEST: gi|33103067|gb|CF063027.1|CF063027
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTEST: gi|94472099|gb|EB701057.1|EB701057
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|78106842|gb|DV525260.1|DV525260
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33101485|gb|CF061445.1|CF061445
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACCTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTEST: gi|113691340|gb|DW850428.1|DW850428
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGT
EST: CGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|71431480|gb|DR812530.1|DR812530
genomic: CGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|40335029|gb|CK369099.1|CK369099
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCCCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|6022649|gb|AW067461.1|AW067461
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTG-ACCTGAAGAGCACTEST: gi|60345075|gb|DN212048.1|DN212048
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|93283525|gb|EB675789.1|EB675789
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60340358|gb|DN207331.1|DN207331
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|31405944|gb|CD484676.1|CD484676
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|32932830|gb|CF037642.1|CF037642
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTEST: gi|33093407|gb|CF053401.1|CF053401
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTEST: gi|15590095|gb|BI674711.1|BI674711
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTEST: gi|33092605|gb|CF052599.1|CF052599
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCEST: gi|32165024|gb|CD670342.1|CD670342
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33101024|gb|CF060984.1|CF060984
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTEST: gi|60397286|gb|DN230102.1|DN230102
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|71427092|gb|DR808142.1|DR808142
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|21391104|gb|BQ529153.1|BQ529153
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|91874847|gb|EB404804.1|EB404804
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: ATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCCTTGAAAAAGAATTTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCCTGAAEST: gi|33092991|gb|CF052985.1|CF052985
genomic: ATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTC-TTGAAAAAGAATT-GGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACC-TGAA
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTEST: gi|5871381|gb|AW017852.1|AW017852
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|32938208|gb|CF043027.1|CF043027
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTAEST: gi|37380190|gb|CF626881.1|CF626881
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTA
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCCCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60342211|gb|DN209184.1|DN209184
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60354949|gb|DN221922.1|DN221922
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60394512|gb|DN227382.1|DN227382
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33092920|gb|CF052914.1|CF052914
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTAEST: gi|4628221|gb|AI619095.1|AI619095
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTA
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60397985|gb|DN230801.1|DN230801
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|29130047|gb|CB380751.1|CB380751
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|71427093|gb|DR808143.1|DR808143
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33103256|gb|CF063216.1|CF063216
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCEST: gi|6031328|gb|AW076185.1|AW076185
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGG-GTACCGGCTGTEST: gi|60341768|gb|DN208741.1|DN208741
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|22819602|gb|BU499692.1|BU499692
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33093653|gb|CF053647.1|CF053647
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTEST: gi|60394706|gb|DN227576.1|DN227576
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|78118451|gb|DV536836.1|DV536836
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60398182|gb|DN230998.1|DN230998
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60359382|gb|DN226355.1|DN226355
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|67025594|gb|CO454343.1|CO454343
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|78083265|gb|DV511658.1|DV511658
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|166451975|gb|EG101399.1|EG101399
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCCCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCEST: gi|60341725|gb|DN208698.1|DN208698
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|60341972|gb|DN208945.1|DN208945
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|18177807|gb|BM379017.1|BM379017
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCCCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|78022302|gb|DV490689.1|DV490689
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|45847495|gb|CN071438.1|CN071438
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AATGAGTGTCAACTTACCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAEST: gi|5713924|gb|AI943909.1|AI943909
genomic: AATGAGTGTCAACTT-CCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGA
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|32802922|gb|CD955158.1|CD955158
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAACACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33103345|gb|CF063305.1|CF063305
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTEST: gi|67040988|gb|CO467243.1|CO467243
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGT
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|31910118|gb|CD651264.1|CD651264
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|5739582|gb|AI947377.1|AI947377
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|67017615|gb|CO446364.1|CO446364
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|29543486|gb|CB603868.1|CB603868
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|33103116|gb|CF063076.1|CF063076
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCEST: gi|61118288|gb|DN559249.1|DN559249
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTCEST: gi|5361220|gb|AI795640.1|AI795640
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
EST: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAAT GTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
genomic: AAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcct ... gtgtttgcagGTGAGATGCTTGTACCTGAAGAGCACTATGGGAAAGGTGTACCGGCTGTTC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGCTGTTGGCAACTGCGGCATGGATGAGAAGCAGATCTTCCAGAATGTGCAAATGAGTGTCAACTTCCTCGTGTCGCTCTTGAAAAAGAATTGGCAGAATgtatgttcctcacatctgtataaaattaatgcttatgttctaaaatatgactatccactgggctaactgtcatcttgtgtgtttgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAAGAA