Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GGCTGGAAGAACTTTAGCAAGATCGCGAGGGATTTGGTGCGTTGTATGCAAAAAATAGATGGTGACTATTATCCTGAGgttagcctcagtatagagatgattgaatgtagcttggtgacttggtttaaaaccattctgatttccaagcttgtcacaaattatgcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G014994_T03
intron # 5
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G014994_T03 (Zea mays), 5'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os02g48990.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
GGCTGGAAGAACTTTAGCAAGATCGCGAGGGATTTGGTGCGTTGTATGCAAAAAATAGATGGTGACTATTATCCTGAGgttagcctcagtatagagatgattgaatgtagcttggtgacttggtttaaaaccattctgatttccaagcttgtcacaaattatgcag
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |  | | |         ||  ||| |||        | |  |||  || ||| |||| | ||||||||| |  |||| ||||||
GGTTGGAAGAACTTTAGCAAGATCGCAAGGGATTTGGTGCGCTGTATGCAGAAAATAGATGGTGATTATTATCCTGAGgtaggtgttactt--------atgaaatttag-------gcctattttgtaatcatgctgactaccaagcttgccctaaatcatgcag