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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AAGAAAGTGCTGCATCCGATCATCTCCTGCGCACTCTGTGCAGATTTCGCGGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAGgtgtgcataagctgtaaaccctaacataagtcctacaattatataacatgttgtacaatttgttttagttccagaagttcagaaaaaaaaattgtttgtccacag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM5G873519_T02
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|76285584|gb|DV025152.1|DV025152
EST:     GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAG                         GTGCTTACCTCACAAAGGTGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTAA
genomic: GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAGgtgtgcataa ... ttgtccacagGTGCTTACCTCACAAAGGTGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTAA
EST: gi|32851469|gb|CD991150.1|CD991150
EST:     GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCTGTGCTAG                         GTGCTTACCTCACAAAGGTGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTAA
genomic: GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAGgtgtgcataa ... ttgtccacagGTGCTTACCTCACAAAGGTGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTAA
EST: gi|211315102|gb|FL381332.1|FL381332
EST:     GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTGGGACTTGATGCCGTGCTAG                         GTGCTTACCTCACAAAGGTGCC
genomic: GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAGgtgtgcataa ... ttgtccacagGTGCTTACCTCACAAAGGTGCC
EST: gi|211200162|gb|FL429646.1|FL429646
EST:     GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAG                         GTGCTTACCTCACAAAGGTGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTAA
genomic: GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAGgtgtgcataa ... ttgtccacagGTGCTTACCTCACAAAGGTGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTAA
EST: gi|211231751|gb|FL386173.1|FL386173
EST:     GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAG                         GTGCTTACCTCACAAAGGGTGCCCTCTA-TCCTGGAGCCGGTGACGTACTA
genomic: GGCGCTAGCCTATGGGTACATCTCAGGGTTTGGACTTGATGCCGTGCTAGgtgtgcataa ... ttgtccacagGTGCTTACCTCACAAAGG-TGCCCTCTAATCCTGGAGCCGGTGACGTACTA