1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
CTATGGGCCAATGGGTTTTGATATTGGAGCCTTCCTTGGAAACCTGATTTTGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAGgtatgcatgaatctgttagcttgttaattttgcaccctttataattccaagtctccaatggtagtattatacatggtttactcatacatgtacttggctt...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G464137_T03 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAG GCTTACAAGAAATGGATCTTGAAGACAATTGAAGAGTCGTGGAATTTGGTCEST: gi|32929601|gb|CF034413.1|CF034413
genomic: TGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAGgtatgcatga ... tcttctgcagGCTTACAAGAAATGGATCTTGAAGACAATTGAAGAGTCGTGGAATTTGTTC
EST: TGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAG GCTTACAAGAAATGGATCTTGAAGACAATTGAAGAGTCGTGGAATTTGTTCEST: gi|32928909|gb|CF033721.1|CF033721
genomic: TGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAGgtatgcatga ... tcttctgcagGCTTACAAGAAATGGATCTTGAAGACAATTGAAGAGTCGTGGAATTTGTTC
EST: TGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAG GCTTACAAGAAATGGATCTTGAAGCCAATTGAAGAGTCGTGGAATTTGTTC
genomic: TGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAGgtatgcatga ... tcttctgcagGCTTACAAGAAATGGATCTTGAAGACAATTGAAGAGTCGTGGAATTTGTTC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CTATGGGCCAATGGGTTTTGATATTGGAGCCTTCCTTGGAAACCTGATTTTGGCATACTATGCACAGAATGGGCATGCTGATCAAGCGAATGATCGTAAGgtatgcatgaatctgttagcttgttaattttgcaccctttataattccaagtctccaatggtagtattatacatggtttactcatacatgtacttggctt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT