1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
GTCGCATTGAAATTAGAGCATCGAAACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgctcatcctgccttcttttctttttgtggagactttctttctgactattggtattgtttgctag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G164265_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCAEST: gi|148950416|gb|EC895983.2|EC895983
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
EST: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCAEST: gi|18654924|gb|BM499729.1|BM499729
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
EST: ANCAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCAEST: gi|18661950|gb|BM501665.1|BM501665
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
EST: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCAEST: gi|149102516|gb|EE188222.2|EE188222
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
EST: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCAEST: gi|148950557|gb|EC896134.2|EC896134
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
EST: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGEST: gi|71430775|gb|DR811825.1|DR811825
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGG
EST: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAA CACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
genomic: AACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgct ... tgtttgctagCACTCTCAATGGTTGCTATGGCATACCATCGGTCCACTACAAGGGTCGTCA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTCGCATTGAAATTAGAGCATCGAAACAGTAAAGGATGCAATTATGGCCCTCCATATGAGTGGCAGGTTTATAAgtatgttgctcatcctgccttcttttctttttgtggagactttctttctgactattggtattgtttgctag
- - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG