1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
CCCTCAAAAACAGCTAAGGATGATGTTTGATCCAGTTCGTCTGTATGCAACGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatatttgaactgttcttgttctttttatctcatggccttattctctttttttttcaccatggacaaaccaaatatcattactcaagagcaacgg...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G161988_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTCG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCCEST: gi|211367194|gb|FL206097.1|FL206097
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTCG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCCEST: gi|211367190|gb|FL206093.1|FL206093
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGEST: gi|211213537|gb|FL454950.1|FL454950
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAG
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCCEST: gi|149009678|gb|EE041610.2|EE041610
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCCEST: gi|211364538|gb|FL206089.1|FL206089
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTCG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCCEST: gi|211367192|gb|FL206095.1|FL206095
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
EST: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGG ATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
genomic: CGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatat ... aactgggcagATTCATGACAAGCTGCTAACACTGATCGCTGTCATATGTGAGATCTGCGCC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCCTCAAAAACAGCTAAGGATGATGTTTGATCCAGTTCGTCTGTATGCAACGGCTGTTTATGTTGGATGTGTTGTTTTGGCTCTAATCTTTGCTCTTTGGgttcgtatatttgaactgttcttgttctttttatctcatggccttattctctttttttttcaccatggacaaaccaaatatcattactcaagagcaacgg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaaccaaa