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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

TACCTCTTTGCTGGTGTTGTGGATGGACGCAACATCTGGGCTGATGATCTTGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgcttgcacttattgtctgtcataaaattggatttagttacagctggcaatatctgataatgcctaccatctgttcag

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G149751_T06
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G149751_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 6
lower sequence: LOC_Os12g42884.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 6
TACCTCTTTGCTGGTGTTGTGGATGGACGCAACATCTGGGCTGATGATCTTGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgta----atcatgcttgcacttattgtctgtcataaaattggatttagttacagctggcaatatctgataatgcctacca--tctgttcag-------------------------
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TACCTCTTTGCTGGTGTTGTGGATGGACGCAACATCTGGGCTGATGATCTCGCCGCATCTCTCACCACCCTCGAGTCTCTTGAGGCTATTGTTGGAAAGGgtaagcaattaagcatgaagttattatatatgttatattttaat--gggcacaatttgcagtatccaataatatcctcaatttctgctcatccaacaatacctttcatttctgtag

upper sequence: GRMZM2G149751_T02 (Zea mays), 5'ss of exon 6
lower sequence: LOC_Os12g42876.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 5
TACCTCTTTGCTGGTGTTGTGGATGGACGCAACATCTGGGCTGATGATCTTGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgta----atcatgcttgcacttattgtctgtcataaaattggatttagttacagctggcaatatctgataatgcctaccatctgttcag---------------------------
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TACCTCTTTGCCGGTGTTGTGGATGGACGCAACATCTGGGCTGATGATCTCGCTGCATCTCTCACTACCCTTGAGTCTCTTGAGGCTATTGTTGGAAAGGgtaagcaattaagcatgaagttattatatctgttatattttaat--aggtacaatttgctgtatccaataatatcctcaatttctgcacatccaacaatacctttcatttctgcag
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|5566727|gb|AI881593.1|AI881593
EST:     CTTGAGGCTGTTGCTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: CTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211083043|gb|FL423995.1|FL423995
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211263537|gb|FL369192.1|FL369192
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211106466|gb|FL269549.1|FL269549
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211214548|gb|FL384289.1|FL384289
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211445887|gb|FL403734.1|FL403734
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|71436763|gb|DR817813.1|DR817813
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211062883|gb|FL385125.1|FL385125
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211059641|gb|FL374513.1|FL374513
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCCGCTGTGGAT
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACC-GCTGTGGAT
EST: gi|211106464|gb|FL269547.1|FL269547
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211392877|gb|FL400615.1|FL400615
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTG
EST: gi|211199604|gb|FL408267.1|FL408267
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTTGTGGAT
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCT-GTGGAT
EST: gi|67018424|gb|CO447173.1|CO447173
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211106465|gb|FL269548.1|FL269548
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211107368|gb|FL269551.1|FL269551
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|18650007|gb|BM498826.1|BM498826
EST:     CCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: CCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211461646|gb|FL410735.1|FL410735
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211199168|gb|FL385131.1|FL385131
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211300927|gb|FL387927.1|FL387927
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211221450|gb|FL389604.1|FL389604
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTG
EST: gi|211357841|gb|FL383499.1|FL383499
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGNATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33101475|gb|CF061435.1|CF061435
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211258668|gb|FL369169.1|FL369169
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211107371|gb|FL269554.1|FL269554
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211156639|gb|FL401279.1|FL401279
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTTGNCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGGCACACCGCTG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTT-GTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATG-CACACCGCTG
EST: gi|211332405|gb|FL404943.1|FL404943
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211303138|gb|FL392462.1|FL392462
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211020410|gb|FL417359.1|FL417359
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAAG                         ACAAGCTTGTCGNATCAACTTCCTGCTCGCTCATGGACACCG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCG
EST: gi|211298414|gb|FL370613.1|FL370613
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211374585|gb|FL413736.1|FL413736
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCAGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211019868|gb|FL398175.1|FL398175
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         AAAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCA
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCA
EST: gi|23199684|gb|BU582249.1|BU582249
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33101251|gb|CF061211.1|CF061211
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211456530|gb|FL403805.1|FL403805
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACA
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACA
EST: gi|9952035|gb|BE638618.1|BE638618
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211168264|gb|FL426160.1|FL426160
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211390246|gb|FL400599.1|FL400599
EST:     GCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGNNAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCCTGCTCGCTCATGCACACC
genomic: GCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGG-AAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCC-TGCTCGCTCATGCACACC
EST: gi|33101222|gb|CF061182.1|CF061182
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211061355|gb|FL332106.1|FL332106
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACT
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACT
EST: gi|211338871|gb|FL392005.1|FL392005
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33102528|gb|CF062488.1|CF062488
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33101156|gb|CF061116.1|CF061116
EST:     TCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|18384329|gb|BM417528.1|BM417528
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211107370|gb|FL269553.1|FL269553
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Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
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TACCTCTTTGCTGGTGTTGTGGATGGACGCAACATCTGGGCTGATGATCTTGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgcttgcacttattgtctgtcataaaattggatttagttacagctggcaatatctgataatgcctaccatctgttcag

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