1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
GTTGCTATTGTTGTTGGCGGTGGCAATATCTTCCGTGGGGCCTCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgttcaatgcccttattctatgctcagctgttaagtagatttaaaaaggagttgaatgcaataaagtatgatatagctaagccaaataatgaaa...
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G139462_T03 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAGEST: gi|76013765|gb|DT940935.1|DT940935
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAGEST: gi|50338057|gb|CO533183.1|CO533183
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTEST: gi|50326142|gb|CO521268.1|CO521268
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTT
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAGEST: gi|86466839|gb|DY233209.1|DY233209
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
EST: TCTTGGGCTGTATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCAGATTACATCGG CATGCTGCCCACTGAGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAGEST: gi|33467006|gb|CF244055.1|CF244055
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAGEST: gi|86468321|gb|DY234691.1|DY234691
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCAGTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGAGGGAGAGEST: gi|148960321|gb|EE153577.2|EE153577
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
EST: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGG CATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
genomic: TCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgtt ... cctaattcagCATGCTGGCCACTGTGATGAATGCTATATTTCTTCAAGCGACGATGGAGAG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTTGCTATTGTTGTTGGCGGTGGCAATATCTTCCGTGGGGCCTCTTGGGCTGGATGTAGTGGGCTTGACCGCTCATCTGCGGATTACATCGGgtaagatgttcaatgcccttattctatgctcagctgttaagtagatttaaaaaggagttgaatgcaataaagtatgatatagctaagccaaataatgaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - aaaaagga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gcaataaa