1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
TGGTGATATTTTATGATTGTGTGGATCTTGTTCAGGACATGGATGGAGTTACCCATGTGATATCTGGAGTGTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaatgggaccttggcttcatttggcatgtacaagtaccaggggatctgagttaccaaggttgtgcag
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G063792_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: ACCCATGTGATATCTGGAGTGTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACG GGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATGEST: gi|113698224|gb|DW851180.1|DW851180
genomic: ACCCATGTGATATCTGGAGTGTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaat ... ggttgtgcagGGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATG
EST: GTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACG GGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATGEST: gi|211114732|gb|FL311570.1|FL311570
genomic: GTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaat ... ggttgtgcagGGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATG
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genomic: CCCATGTGATATCTGGAGTGTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaat ... ggttgtgcagGGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATG
EST: CTTGTTGAGCTTTGCACG GGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATGEST: gi|60348903|gb|DN215876.1|DN215876
genomic: CTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaat ... ggttgtgcagGGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATG
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genomic: ACCCATGTGATATCTGGAGTGTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaat ... ggttgtgcagGGTGAGGCGTTATTCCAGACTCACGAAAACTTGGAACATCTGGCTATGATG
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| TGGTGATATTTTATGATTGTGTGGATCTTGTTCAGGACATGGATGGAGTTACCCATGTGATATCTGGAGTGTTGGTTGTATTCTTGTTGAGCTTTGCACGgtatgttaatgggaccttggcttcatttggcatgtacaagtaccaggggatctgagttaccaaggttgtgcag
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