Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AACAGATTCTTGCTGTTGGGTGCAGTAGAGGTGTTGTTGAATTGTATGATCTTGCAGAAAACACACGGCATATACGAACCATTTCGTTGTATGATTGGGGgtaagtctcgcatgatatattattgttcacaagcaatagtagctgttacatggattcatctgattgactgcctaaatttctgtaagtttatttcaaattt...

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G052750_T01
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G052750_T01 (Zea mays), 5'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os02g54500.1 (Oryza sativa), 5'ss of exon 4
AACAGATTCTTGCTGTTGGGTGCAGTAGAGGTGTTGTTGAATTGTATGATCTTGCAGAAAACACACGGCATATACGAACCATTTCGTTGTATGATTGGGGgtaagtctcgcatgatatattattgttcacaagcaatagtagctgttacatggattcatctgattgactgcc-taaatttctgtaagtttatttcaaattt--
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||  || ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |    || ||  |     |  ||||  | |  | | |   ||  |||| | ||  |    |||||| ||    ||||     |  |   
AGCAGATTCTTGCTGTTGGGTGCAGTAGAGGTGTTGTTGATTTATATGACCTAGCTGAAAATGCAAGGCATATCCGCACAATTTCTTTGTATGATTGGGGgtaagtctcacacaactatttgttagttctgtg-gatagctgttactgcctaattt--tctggtggatagttgcaaatttgtgcttatttagaaggatatcct